More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1011 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  54.46 
 
 		 935 aa  1031    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  59.05 
 
 		 938 aa  1144    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  46.37 
 
 		 771 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  57.59 
 
 		 942 aa  1107    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  100 
 
 		 931 aa  1917    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  62.12 
 
 		 931 aa  1174    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  47.06 
 
 		 743 aa  662    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  47.1 
 
 		 744 aa  676    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  47.14 
 
 		 844 aa  618  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  47.42 
 
 		 863 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  45.1 
 
 		 843 aa  595  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  44.16 
 
 		 864 aa  581  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  46.24 
 
 		 827 aa  575  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 702 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  43.61 
 
 		 747 aa  509  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  41.97 
 
 		 837 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.09 
 
 		 849 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  39.8 
 
 		 837 aa  485  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  40.03 
 
 		 834 aa  484  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  31.29 
 
 		 780 aa  343  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.4 
 
 		 855 aa  327  7e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  33.73 
 
 		 853 aa  321  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  34.66 
 
 		 610 aa  318  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  33.28 
 
 		 817 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  31.99 
 
 		 814 aa  311  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  31.91 
 
 		 812 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  31.64 
 
 		 814 aa  302  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  34.97 
 
 		 604 aa  294  6e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  33.39 
 
 		 602 aa  287  7e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  33.28 
 
 		 604 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  34.09 
 
 		 596 aa  280  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  33.45 
 
 		 631 aa  278  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 668 aa  245  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  30.77 
 
 		 863 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  28.88 
 
 		 616 aa  233  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  31.31 
 
 		 691 aa  229  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  29.91 
 
 		 693 aa  220  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  28.27 
 
 		 684 aa  218  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 743 aa  217  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  27.9 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  29.36 
 
 		 868 aa  215  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  30.34 
 
 		 708 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  32.08 
 
 		 857 aa  213  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1425  DNA topoisomerase III  28.08 
 
 		 683 aa  212  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.771336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1738  DNA topoisomerase III  27.7 
 
 		 699 aa  212  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 690 aa  211  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  30.12 
 
 		 768 aa  211  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 872 aa  210  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  27.42 
 
 		 655 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  31.22 
 
 		 849 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  31.24 
 
 		 852 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 689 aa  208  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  27.09 
 
 		 669 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 696 aa  208  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  31.16 
 
 		 695 aa  208  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  29.84 
 
 		 710 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  30.18 
 
 		 693 aa  207  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  27.83 
 
 		 828 aa  207  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 702 aa  206  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  27.85 
 
 		 654 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  29.78 
 
 		 793 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  26.98 
 
 		 671 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 700 aa  205  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 697 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  30.65 
 
 		 694 aa  204  7e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.72 
 
 		 700 aa  204  7e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 851 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  29.23 
 
 		 694 aa  203  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 851 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 867 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  28.97 
 
 		 895 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  29.33 
 
 		 695 aa  202  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 880 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  29.64 
 
 		 876 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  32.34 
 
 		 824 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  30.13 
 
 		 783 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  28.97 
 
 		 880 aa  201  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  27.22 
 
 		 655 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 880 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  28.5 
 
 		 889 aa  201  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 880 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 880 aa  201  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  30.07 
 
 		 700 aa  201  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4319  DNA topoisomerase III  27.05 
 
 		 687 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.535821  normal  0.574882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  31.26 
 
 		 758 aa  200  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  28.88 
 
 		 892 aa  200  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 879 aa  200  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 869 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 869 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.26 
 
 		 836 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 869 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 866 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 865 aa  199  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 865 aa  199  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1803  DNA topoisomerase I  29.22 
 
 		 906 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0789615  hitchhiker  0.0000387309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 865 aa  199  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 866 aa  198  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29 
 
 		 868 aa  199  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  27.65 
 
 		 865 aa  199  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 865 aa  198  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>