More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0026 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  66.25 
 
 		 814 aa  1082    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  63.42 
 
 		 817 aa  1074    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 853 aa  1728    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  67.13 
 
 		 814 aa  1080    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  67.01 
 
 		 812 aa  1103    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  32.41 
 
 		 747 aa  363  1e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  29.27 
 
 		 837 aa  334  4e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  34.47 
 
 		 771 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 863 aa  327  5e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  31.37 
 
 		 744 aa  325  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 743 aa  323  8e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  33.73 
 
 		 931 aa  321  3e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  29.06 
 
 		 843 aa  320  7.999999999999999e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 702 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 844 aa  318  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  28.04 
 
 		 837 aa  319  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  28.91 
 
 		 849 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 827 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  34.33 
 
 		 668 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  27.36 
 
 		 834 aa  300  9e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  33.03 
 
 		 931 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  30.83 
 
 		 942 aa  287  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.45 
 
 		 938 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.26 
 
 		 864 aa  283  9e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  32.13 
 
 		 935 aa  283  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 768 aa  254  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 841 aa  252  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  28.56 
 
 		 853 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  29.96 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  29.96 
 
 		 765 aa  248  4e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  31.58 
 
 		 756 aa  247  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.73 
 
 		 693 aa  246  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 851 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 851 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  31.32 
 
 		 758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.66 
 
 		 704 aa  244  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  26.64 
 
 		 855 aa  244  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  27.14 
 
 		 780 aa  243  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  28 
 
 		 746 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  27.07 
 
 		 793 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  27.12 
 
 		 760 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  30.92 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 747 aa  237  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  27.62 
 
 		 865 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  29.34 
 
 		 689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  27.62 
 
 		 865 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.95 
 
 		 700 aa  236  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  27.17 
 
 		 865 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.95 
 
 		 700 aa  235  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  29.22 
 
 		 702 aa  235  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  27.17 
 
 		 865 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  28.47 
 
 		 759 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  26.89 
 
 		 865 aa  234  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 865 aa  234  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  27.06 
 
 		 865 aa  234  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 865 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 865 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 865 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  28.47 
 
 		 759 aa  234  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 865 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  26.76 
 
 		 865 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.34 
 
 		 695 aa  234  7.000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 865 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  31.3 
 
 		 757 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 700 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 751 aa  234  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 700 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  26.76 
 
 		 865 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 691 aa  232  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  27.56 
 
 		 865 aa  232  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  30.66 
 
 		 693 aa  233  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  26.55 
 
 		 758 aa  233  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  29.51 
 
 		 898 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  29.97 
 
 		 702 aa  231  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  27.98 
 
 		 700 aa  231  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.82 
 
 		 868 aa  230  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 694 aa  230  8e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  28.82 
 
 		 868 aa  230  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  28.54 
 
 		 876 aa  229  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  27.61 
 
 		 696 aa  229  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 694 aa  226  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  28.68 
 
 		 865 aa  226  2e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  27.43 
 
 		 710 aa  226  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  26.28 
 
 		 836 aa  225  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 876 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  29.32 
 
 		 610 aa  224  7e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 804 aa  223  9e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 868 aa  223  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  26.47 
 
 		 831 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  26.71 
 
 		 831 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  30.5 
 
 		 779 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  27.18 
 
 		 789 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  26.65 
 
 		 696 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  27.61 
 
 		 798 aa  221  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 684 aa  221  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 868 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  26.25 
 
 		 831 aa  220  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  30.23 
 
 		 779 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.18 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  27.34 
 
 		 880 aa  219  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>