More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0859 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  61.91 
 
 		 931 aa  1177    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  57.59 
 
 		 931 aa  1107    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  100 
 
 		 942 aa  1932    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  54.39 
 
 		 935 aa  1011    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  44.86 
 
 		 744 aa  653    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  62.43 
 
 		 938 aa  1205    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  42.4 
 
 		 743 aa  620  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 771 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  46.69 
 
 		 844 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  46.03 
 
 		 863 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  44.01 
 
 		 843 aa  556  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  46.02 
 
 		 827 aa  546  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  42.8 
 
 		 864 aa  543  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  43.64 
 
 		 702 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  42.96 
 
 		 747 aa  498  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  39.12 
 
 		 834 aa  474  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  38.68 
 
 		 837 aa  468  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.91 
 
 		 837 aa  465  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.41 
 
 		 849 aa  461  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  29.94 
 
 		 780 aa  320  9e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.4 
 
 		 855 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  32.63 
 
 		 817 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  30.9 
 
 		 812 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  31.36 
 
 		 814 aa  299  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  31.07 
 
 		 814 aa  298  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  30.83 
 
 		 853 aa  288  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  33.99 
 
 		 604 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  34.18 
 
 		 604 aa  280  7e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.56 
 
 		 610 aa  277  6e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  33.78 
 
 		 602 aa  277  7e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  33.5 
 
 		 631 aa  273  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  33.33 
 
 		 596 aa  265  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  30.93 
 
 		 668 aa  253  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  30.28 
 
 		 616 aa  248  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  28.78 
 
 		 868 aa  231  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 		 691 aa  231  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  28.86 
 
 		 863 aa  231  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 689 aa  230  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  30.02 
 
 		 828 aa  224  7e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  27.94 
 
 		 768 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  32.01 
 
 		 857 aa  220  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  30.36 
 
 		 793 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  26.39 
 
 		 702 aa  218  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 743 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  30.76 
 
 		 700 aa  213  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  30.08 
 
 		 708 aa  212  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  28.5 
 
 		 629 aa  211  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 693 aa  211  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 693 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  27.4 
 
 		 684 aa  209  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  29.97 
 
 		 789 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  30.07 
 
 		 700 aa  207  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 746 aa  206  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  29.74 
 
 		 849 aa  205  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  31.61 
 
 		 797 aa  205  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  28.95 
 
 		 836 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 852 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.55 
 
 		 693 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  28.97 
 
 		 758 aa  203  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.69 
 
 		 694 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 759 aa  201  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 696 aa  201  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 876 aa  200  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  28.22 
 
 		 697 aa  200  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  28 
 
 		 768 aa  200  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 759 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  29.85 
 
 		 845 aa  199  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  28.87 
 
 		 859 aa  198  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  27.65 
 
 		 694 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  27.12 
 
 		 690 aa  197  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.62 
 
 		 751 aa  197  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 884 aa  197  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  27.99 
 
 		 780 aa  197  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 		 758 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 		 879 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  28.02 
 
 		 673 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  28.8 
 
 		 836 aa  195  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  26.34 
 
 		 868 aa  195  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 876 aa  195  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 757 aa  195  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  26.31 
 
 		 756 aa  195  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  29.5 
 
 		 868 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 886 aa  195  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.61 
 
 		 760 aa  195  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2033  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 871 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1923  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 871 aa  194  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0924763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.46 
 
 		 869 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.46 
 
 		 869 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.46 
 
 		 869 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 710 aa  194  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 695 aa  193  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  28.47 
 
 		 820 aa  193  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  28.13 
 
 		 765 aa  193  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 868 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  27.82 
 
 		 758 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  28.29 
 
 		 876 aa  193  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  27.26 
 
 		 641 aa  193  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  25.78 
 
 		 700 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>