More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0323 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  47.45 
 
 
914 aa  803    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  44.63 
 
 
909 aa  753    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  44.62 
 
 
888 aa  751    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  46.36 
 
 
916 aa  742    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  44.39 
 
 
910 aa  749    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  49.56 
 
 
768 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  60.75 
 
 
816 aa  1018    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  46.79 
 
 
884 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  48.26 
 
 
877 aa  824    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  45.5 
 
 
913 aa  767    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  47.66 
 
 
891 aa  793    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  49.12 
 
 
759 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  49.12 
 
 
759 aa  635    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  46.9 
 
 
901 aa  784    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  44.68 
 
 
880 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  44.39 
 
 
910 aa  749    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  43.63 
 
 
894 aa  727    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  100 
 
 
820 aa  1687    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  43.99 
 
 
857 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  45.89 
 
 
911 aa  751    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  44.15 
 
 
884 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  49.29 
 
 
915 aa  829    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  47.43 
 
 
894 aa  814    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  46.49 
 
 
911 aa  755    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  43.21 
 
 
859 aa  675    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0594  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 
827 aa  742    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  47.27 
 
 
884 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  90.35 
 
 
820 aa  1545    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  42.03 
 
 
907 aa  684    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  47.5 
 
 
922 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  46.63 
 
 
845 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  46.49 
 
 
914 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  47.07 
 
 
869 aa  786    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  45.89 
 
 
936 aa  745    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  48.5 
 
 
885 aa  816    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  43.21 
 
 
900 aa  698    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  43.15 
 
 
893 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  44.62 
 
 
849 aa  700    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  47.19 
 
 
849 aa  803    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  46.79 
 
 
904 aa  800    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  47.9 
 
 
877 aa  816    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  47.42 
 
 
867 aa  783    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41359  predicted protein  43.63 
 
 
840 aa  638    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  46.52 
 
 
924 aa  790    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  43.7 
 
 
852 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  47.03 
 
 
961 aa  772    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  45.47 
 
 
977 aa  751    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  47.79 
 
 
896 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  46.49 
 
 
911 aa  768    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  45.02 
 
 
851 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  44.15 
 
 
884 aa  703    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  47.8 
 
 
851 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  47.8 
 
 
851 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  47.43 
 
 
776 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  48.01 
 
 
756 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  47.47 
 
 
783 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  48.08 
 
 
758 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  41.84 
 
 
815 aa  601  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  46.76 
 
 
765 aa  601  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  44.56 
 
 
854 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  47.43 
 
 
779 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  49.06 
 
 
758 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 
779 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  46.25 
 
 
765 aa  598  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  41.6 
 
 
815 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  42.6 
 
 
834 aa  591  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  48.19 
 
 
757 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  50.87 
 
 
783 aa  588  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  45.34 
 
 
841 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  43.04 
 
 
799 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  41.75 
 
 
797 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  46.33 
 
 
823 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  39.18 
 
 
830 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  43.3 
 
 
836 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  43.41 
 
 
789 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  50.09 
 
 
824 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  43.08 
 
 
780 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  45.44 
 
 
696 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  44.84 
 
 
793 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  45.38 
 
 
711 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  41.82 
 
 
711 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  38.22 
 
 
872 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 
710 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  37.05 
 
 
858 aa  532  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  44.59 
 
 
703 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  41.28 
 
 
853 aa  528  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  43.82 
 
 
758 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  44.81 
 
 
692 aa  527  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  46.76 
 
 
693 aa  528  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 
703 aa  525  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  41.97 
 
 
859 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  44.65 
 
 
697 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  43.6 
 
 
751 aa  525  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  44.21 
 
 
692 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  44.21 
 
 
692 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  45.41 
 
 
746 aa  522  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  45.35 
 
 
691 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  43.55 
 
 
694 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  42.71 
 
 
767 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  44.21 
 
 
692 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>