More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3689 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  45.78 
 
 		 706 aa  636    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  83.36 
 
 		 757 aa  1298    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  44.75 
 
 		 692 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  46.38 
 
 		 758 aa  652    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  47.68 
 
 		 691 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  55.36 
 
 		 768 aa  870    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  46.04 
 
 		 748 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  44.89 
 
 		 692 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  47.42 
 
 		 760 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  45.29 
 
 		 692 aa  641    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  54.74 
 
 		 824 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  47.84 
 
 		 758 aa  702    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  45.15 
 
 		 692 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  45.02 
 
 		 692 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  45.15 
 
 		 692 aa  641    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  54.3 
 
 		 759 aa  842    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  54.57 
 
 		 759 aa  845    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  47.87 
 
 		 693 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  45.83 
 
 		 813 aa  689    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  47.68 
 
 		 696 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  46.32 
 
 		 702 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  51.84 
 
 		 783 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  49.27 
 
 		 914 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  67.55 
 
 		 841 aa  1078    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  49.53 
 
 		 780 aa  706    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  45.13 
 
 		 751 aa  656    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  46.68 
 
 		 695 aa  640    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  50.6 
 
 		 836 aa  739    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  84.04 
 
 		 758 aa  1321    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  46.46 
 
 		 747 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  45.15 
 
 		 692 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  47.98 
 
 		 711 aa  692    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  44.35 
 
 		 831 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  54.82 
 
 		 851 aa  874    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  44.65 
 
 		 831 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  53.83 
 
 		 815 aa  659    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  54.93 
 
 		 823 aa  674    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  54.12 
 
 		 845 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  44.89 
 
 		 692 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  45.02 
 
 		 697 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  46.47 
 
 		 710 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  45.8 
 
 		 853 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  54.78 
 
 		 765 aa  838    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  55.07 
 
 		 854 aa  666    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  44.35 
 
 		 831 aa  668    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  82.58 
 
 		 779 aa  1294    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  46.66 
 
 		 691 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  46.68 
 
 		 894 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  82.58 
 
 		 779 aa  1295    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  54.62 
 
 		 834 aa  658    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  53.34 
 
 		 830 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  50.36 
 
 		 797 aa  672    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  77.78 
 
 		 758 aa  1185    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  53.67 
 
 		 815 aa  655    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  54.82 
 
 		 851 aa  874    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  48.17 
 
 		 767 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  56.7 
 
 		 783 aa  882    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  48.85 
 
 		 793 aa  724    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 756 aa  1553    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  78.4 
 
 		 776 aa  1235    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  45.15 
 
 		 692 aa  641    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 789 aa  727    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  54.65 
 
 		 765 aa  835    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.99 
 
 		 711 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  46.54 
 
 		 691 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  50.91 
 
 		 857 aa  632  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  44.75 
 
 		 692 aa  635  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  48.91 
 
 		 904 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  44.75 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  44.01 
 
 		 894 aa  631  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  47.03 
 
 		 915 aa  631  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  51.58 
 
 		 799 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  45.74 
 
 		 746 aa  629  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  49.28 
 
 		 916 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  46.84 
 
 		 859 aa  627  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  48.15 
 
 		 913 aa  625  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  49.26 
 
 		 884 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  49.7 
 
 		 867 aa  624  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  50.07 
 
 		 961 aa  625  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  43.77 
 
 		 693 aa  625  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  49.03 
 
 		 911 aa  621  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  48.96 
 
 		 936 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  48.68 
 
 		 884 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 700 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 700 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  44.99 
 
 		 694 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  47.2 
 
 		 703 aa  615  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  48.01 
 
 		 820 aa  616  1e-175  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  46.64 
 
 		 697 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  48.09 
 
 		 909 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  47.06 
 
 		 703 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  48.01 
 
 		 922 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  44.21 
 
 		 696 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  46.74 
 
 		 888 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  47.92 
 
 		 911 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  48.22 
 
 		 977 aa  610  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  47.93 
 
 		 820 aa  612  1e-173  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  48.01 
 
 		 896 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  47 
 
 		 910 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  47.2 
 
 		 703 aa  605  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>