More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2693 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  47.68 
 
 
757 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  45.42 
 
 
768 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  46.28 
 
 
692 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  48.96 
 
 
758 aa  756    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  46.59 
 
 
758 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  100 
 
 
813 aa  1662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  51.03 
 
 
758 aa  755    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  45.95 
 
 
859 aa  635    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  46.68 
 
 
692 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  46.81 
 
 
692 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  46.68 
 
 
692 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  45.24 
 
 
759 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  45.24 
 
 
759 aa  645    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  44.13 
 
 
765 aa  662    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  46.95 
 
 
711 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  49.5 
 
 
793 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  52.65 
 
 
836 aa  757    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  45.64 
 
 
851 aa  670    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  45.83 
 
 
756 aa  692    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  48.45 
 
 
841 aa  708    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  47.16 
 
 
758 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  49.94 
 
 
747 aa  758    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  46.68 
 
 
692 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  46.46 
 
 
693 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  50 
 
 
697 aa  666    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  82.53 
 
 
831 aa  1338    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  46.12 
 
 
702 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  53.24 
 
 
789 aa  757    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  45.86 
 
 
691 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  48.33 
 
 
691 aa  673    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  50.98 
 
 
748 aa  730    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  50.07 
 
 
746 aa  723    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  50.33 
 
 
751 aa  758    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  48.69 
 
 
695 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  45.64 
 
 
851 aa  670    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  47.25 
 
 
693 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  46.94 
 
 
692 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  50.67 
 
 
853 aa  796    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  49.1 
 
 
760 aa  739    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  46.66 
 
 
836 aa  670    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  46.28 
 
 
692 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  56.94 
 
 
894 aa  884    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  46.28 
 
 
692 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  46.18 
 
 
697 aa  673    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  43.44 
 
 
700 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  46.68 
 
 
692 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  45.65 
 
 
696 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  45.18 
 
 
779 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  46.15 
 
 
692 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  45.68 
 
 
694 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  44.26 
 
 
765 aa  663    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  49.22 
 
 
767 aa  738    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  44.58 
 
 
783 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  52.37 
 
 
780 aa  741    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  46.68 
 
 
776 aa  700    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  50.21 
 
 
711 aa  667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  44.56 
 
 
779 aa  666    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  46.15 
 
 
692 aa  646    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  82.23 
 
 
831 aa  1332    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  45.85 
 
 
710 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  82.36 
 
 
831 aa  1335    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  44.55 
 
 
721 aa  634  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  43.57 
 
 
706 aa  634  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  43.42 
 
 
715 aa  632  1e-179  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  47.07 
 
 
696 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  43.55 
 
 
689 aa  629  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 
686 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 
700 aa  628  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  45.63 
 
 
691 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  45.66 
 
 
706 aa  621  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  45.75 
 
 
691 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  45.75 
 
 
691 aa  619  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  43.19 
 
 
703 aa  617  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  44.06 
 
 
706 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  45.75 
 
 
708 aa  616  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  43.06 
 
 
703 aa  615  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  42.8 
 
 
703 aa  612  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  43.53 
 
 
765 aa  608  9.999999999999999e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  42.78 
 
 
743 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  43.92 
 
 
693 aa  597  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  44.4 
 
 
714 aa  598  1e-169  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  43.9 
 
 
865 aa  594  1e-168  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  45.15 
 
 
798 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  43.91 
 
 
802 aa  587  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  44.73 
 
 
804 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  42.09 
 
 
886 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  43.68 
 
 
876 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  43.13 
 
 
868 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  44.3 
 
 
798 aa  581  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  42.67 
 
 
868 aa  582  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  42.67 
 
 
868 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  44.16 
 
 
798 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  42.82 
 
 
870 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  40.54 
 
 
690 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  43 
 
 
869 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  42.69 
 
 
869 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  42.64 
 
 
868 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  42.75 
 
 
869 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  42.29 
 
 
694 aa  570  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  43.02 
 
 
872 aa  572  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>