More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1223 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  47.05 
 
 		 793 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  56.17 
 
 		 706 aa  834    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  49.27 
 
 		 703 aa  693    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  45.78 
 
 		 757 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 697 aa  1440    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  58.54 
 
 		 692 aa  824    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  49.93 
 
 		 721 aa  659    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  56.29 
 
 		 689 aa  832    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  44.77 
 
 		 768 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  58.39 
 
 		 692 aa  823    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  56.16 
 
 		 695 aa  809    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  51.31 
 
 		 706 aa  728    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  57.66 
 
 		 692 aa  822    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  57.62 
 
 		 691 aa  820    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  58.1 
 
 		 692 aa  824    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  58.25 
 
 		 692 aa  825    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  58.1 
 
 		 692 aa  824    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  47.07 
 
 		 684 aa  668    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  46.55 
 
 		 831 aa  695    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  49.14 
 
 		 703 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  46.01 
 
 		 756 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  46.42 
 
 		 831 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  56.05 
 
 		 691 aa  818    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  73.02 
 
 		 710 aa  1068    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  45.09 
 
 		 841 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  46.25 
 
 		 813 aa  677    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  53.62 
 
 		 706 aa  781    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  46.03 
 
 		 758 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  43.45 
 
 		 747 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  58.1 
 
 		 692 aa  824    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  47.79 
 
 		 836 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  63.95 
 
 		 697 aa  917    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  46.35 
 
 		 831 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  57.77 
 
 		 691 aa  798    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  52.54 
 
 		 690 aa  742    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  57.27 
 
 		 691 aa  831    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  57.89 
 
 		 702 aa  838    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  58.1 
 
 		 692 aa  821    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  50.72 
 
 		 715 aa  726    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  55.49 
 
 		 686 aa  783    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  46.52 
 
 		 758 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  61.28 
 
 		 711 aa  902    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  58.1 
 
 		 692 aa  824    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  58.25 
 
 		 692 aa  821    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  45.2 
 
 		 779 aa  661    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  52.35 
 
 		 693 aa  750    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  53.84 
 
 		 711 aa  788    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  57.27 
 
 		 691 aa  831    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  55.3 
 
 		 700 aa  803    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  55.3 
 
 		 700 aa  803    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  57.81 
 
 		 692 aa  816    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  50.29 
 
 		 696 aa  686    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  46.03 
 
 		 894 aa  651    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  56.63 
 
 		 694 aa  841    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  44.91 
 
 		 758 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  45.07 
 
 		 779 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  51.46 
 
 		 708 aa  726    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  49.92 
 
 		 669 aa  668    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  54.11 
 
 		 693 aa  785    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  52.82 
 
 		 694 aa  724    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  51.09 
 
 		 714 aa  724    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  47.36 
 
 		 789 aa  661    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  47.49 
 
 		 767 aa  675    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  57.9 
 
 		 693 aa  849    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  49.29 
 
 		 859 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  45.47 
 
 		 776 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  58.66 
 
 		 696 aa  846    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  49.13 
 
 		 703 aa  689    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  59.63 
 
 		 696 aa  875    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 751 aa  635  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 		 758 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  47.7 
 
 		 780 aa  629  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  42.58 
 
 		 760 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  46.18 
 
 		 836 aa  628  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  46.52 
 
 		 853 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  48.35 
 
 		 708 aa  627  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  43.18 
 
 		 851 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  45.31 
 
 		 759 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 765 aa  622  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  43.18 
 
 		 851 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  44.65 
 
 		 759 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  44.31 
 
 		 765 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  43.13 
 
 		 783 aa  615  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  43.47 
 
 		 746 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  44.62 
 
 		 798 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  43.68 
 
 		 748 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  44.76 
 
 		 804 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  44.13 
 
 		 798 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  43.39 
 
 		 798 aa  589  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  43.7 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  43.72 
 
 		 799 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  43.56 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  43.28 
 
 		 802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  43.56 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  48.87 
 
 		 783 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  42.39 
 
 		 695 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  42.16 
 
 		 702 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  40.43 
 
 		 743 aa  569  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  42.21 
 
 		 694 aa  570  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  43.81 
 
 		 689 aa  569  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>