More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2842 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  70.62 
 
 		 798 aa  1154    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  73.97 
 
 		 802 aa  1266    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  75.69 
 
 		 798 aa  1248    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  70.1 
 
 		 804 aa  1165    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  75.91 
 
 		 798 aa  1284    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 798 aa  1652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  77.54 
 
 		 799 aa  1300    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  45.02 
 
 		 836 aa  626  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  45.23 
 
 		 853 aa  621  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  45.27 
 
 		 789 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  46.79 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  46.63 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 756 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  47.01 
 
 		 710 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  45.41 
 
 		 793 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  44.76 
 
 		 711 aa  591  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  43.39 
 
 		 697 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  44.41 
 
 		 780 aa  588  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  46.37 
 
 		 691 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  43.57 
 
 		 767 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  43.3 
 
 		 768 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  43.95 
 
 		 894 aa  582  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  43.93 
 
 		 751 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  43.01 
 
 		 831 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  42.76 
 
 		 831 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  43.01 
 
 		 831 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  43.98 
 
 		 758 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  43.05 
 
 		 841 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  44.05 
 
 		 758 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  43.56 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  44.94 
 
 		 692 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  44.9 
 
 		 696 aa  571  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  44.26 
 
 		 758 aa  571  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  45.08 
 
 		 692 aa  570  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  43.61 
 
 		 757 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  44.52 
 
 		 692 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  44.66 
 
 		 692 aa  568  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  44.66 
 
 		 692 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  43.25 
 
 		 693 aa  567  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  44.52 
 
 		 692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  42.76 
 
 		 758 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  44.01 
 
 		 702 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 747 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  43.42 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  43.42 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  42.66 
 
 		 813 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 851 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  43.42 
 
 		 746 aa  557  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  44.38 
 
 		 700 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  44.24 
 
 		 700 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 851 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  41.88 
 
 		 776 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  42.52 
 
 		 779 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  43.2 
 
 		 693 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  42.39 
 
 		 779 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  43.55 
 
 		 695 aa  555  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.06 
 
 		 711 aa  554  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  44.72 
 
 		 706 aa  555  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  44.51 
 
 		 706 aa  552  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  44.59 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  43.15 
 
 		 693 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  44.13 
 
 		 706 aa  548  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 669 aa  548  1e-154  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  44.76 
 
 		 714 aa  548  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  41.47 
 
 		 760 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  40.52 
 
 		 765 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  41.85 
 
 		 694 aa  544  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  42.27 
 
 		 783 aa  544  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  42.38 
 
 		 696 aa  545  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  43.71 
 
 		 836 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  43.42 
 
 		 689 aa  542  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  42.08 
 
 		 715 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  40.6 
 
 		 765 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  42.27 
 
 		 686 aa  539  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  41.5 
 
 		 696 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  42.05 
 
 		 748 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  41.76 
 
 		 684 aa  533  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  44.18 
 
 		 859 aa  534  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  41.74 
 
 		 703 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  43.88 
 
 		 694 aa  535  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  41.6 
 
 		 703 aa  530  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  42.4 
 
 		 759 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  42.4 
 
 		 759 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  42.15 
 
 		 690 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  42.94 
 
 		 884 aa  522  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  41.46 
 
 		 703 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  42.03 
 
 		 884 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  42.28 
 
 		 904 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  41.93 
 
 		 914 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  39.2 
 
 		 765 aa  512  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 		 845 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  39 
 
 		 865 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 877 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  43.6 
 
 		 820 aa  507  9.999999999999999e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  42.05 
 
 		 708 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>