More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0191 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  43.79 
 
 		 885 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  46.09 
 
 		 916 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  53.88 
 
 		 757 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 823 aa  1676    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  43.44 
 
 		 884 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  61.41 
 
 		 768 aa  863    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  43.96 
 
 		 816 aa  660    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  44.92 
 
 		 901 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  51.1 
 
 		 758 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  44.91 
 
 		 877 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  70.67 
 
 		 854 aa  1212    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  57.08 
 
 		 759 aa  759    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  57.08 
 
 		 759 aa  758    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 877 aa  676    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  52.74 
 
 		 857 aa  804    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  45.79 
 
 		 911 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  44.22 
 
 		 904 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  68.54 
 
 		 783 aa  1123    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  50.52 
 
 		 841 aa  661    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  46.23 
 
 		 894 aa  698    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  58.96 
 
 		 765 aa  816    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  58.81 
 
 		 765 aa  812    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  57.35 
 
 		 758 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  60.42 
 
 		 815 aa  993    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  43.13 
 
 		 884 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  49.69 
 
 		 915 aa  704    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  61.2 
 
 		 830 aa  980    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  46.28 
 
 		 911 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  44.43 
 
 		 859 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  45.14 
 
 		 922 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  54.25 
 
 		 845 aa  851    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  46.05 
 
 		 914 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  62.58 
 
 		 851 aa  768    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  45.43 
 
 		 936 aa  659    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  44.07 
 
 		 893 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  44.22 
 
 		 849 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  44.01 
 
 		 914 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  65.51 
 
 		 799 aa  1046    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  44.58 
 
 		 849 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  63.38 
 
 		 824 aa  1001    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  47.24 
 
 		 924 aa  703    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  43.84 
 
 		 869 aa  672    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  46.63 
 
 		 911 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  66.88 
 
 		 797 aa  1082    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  60.54 
 
 		 815 aa  998    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  45.74 
 
 		 867 aa  691    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  63.65 
 
 		 834 aa  1059    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  46.91 
 
 		 891 aa  685    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  46.21 
 
 		 961 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  53.87 
 
 		 779 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  52.69 
 
 		 783 aa  711    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  62.58 
 
 		 851 aa  768    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  54.19 
 
 		 776 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  44.97 
 
 		 851 aa  643    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  54.93 
 
 		 756 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  54.03 
 
 		 779 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  44.27 
 
 		 977 aa  652    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  42.98 
 
 		 780 aa  634  1e-180  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  42.63 
 
 		 820 aa  635  1e-180  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  44.71 
 
 		 792 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  44.14 
 
 		 825 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  46.09 
 
 		 896 aa  625  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  43.95 
 
 		 852 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  44.11 
 
 		 894 aa  621  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 		 913 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  44.35 
 
 		 909 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  44.54 
 
 		 835 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  43.11 
 
 		 841 aa  614  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 910 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  44.4 
 
 		 910 aa  612  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  43.18 
 
 		 900 aa  608  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  44.65 
 
 		 888 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  42.82 
 
 		 784 aa  606  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  43.97 
 
 		 841 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  41.62 
 
 		 857 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  51.07 
 
 		 696 aa  598  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  46.33 
 
 		 820 aa  594  1e-168  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  43.84 
 
 		 839 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  51.35 
 
 		 836 aa  591  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  48.93 
 
 		 780 aa  590  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  49.36 
 
 		 711 aa  588  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  44.88 
 
 		 884 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  44.86 
 
 		 884 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  45.11 
 
 		 880 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  49.92 
 
 		 710 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  50.96 
 
 		 789 aa  582  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  41.36 
 
 		 894 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  49.84 
 
 		 697 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  49.43 
 
 		 691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  45.64 
 
 		 793 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  41.97 
 
 		 907 aa  569  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  41.72 
 
 		 872 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0594  DNA topoisomerase I  39.67 
 
 		 827 aa  564  1.0000000000000001e-159  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  49.51 
 
 		 691 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  48.77 
 
 		 702 aa  562  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  47.65 
 
 		 706 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  44.55 
 
 		 767 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  46.43 
 
 		 703 aa  549  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  46.89 
 
 		 697 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  41.69 
 
 		 883 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>