More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00400 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  100 
 
 		 828 aa  1710    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  47.05 
 
 		 629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  46.13 
 
 		 616 aa  527  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  38.31 
 
 		 1009 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  37.68 
 
 		 641 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  34.09 
 
 		 868 aa  323  6e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  33.33 
 
 		 863 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.91 
 
 		 780 aa  261  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  31.25 
 
 		 855 aa  257  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.44 
 
 		 602 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  29.41 
 
 		 604 aa  253  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  29.92 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 747 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  31.36 
 
 		 596 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  30.47 
 
 		 610 aa  246  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  29.29 
 
 		 631 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  29.9 
 
 		 931 aa  239  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  29.78 
 
 		 942 aa  224  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 827 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  27.93 
 
 		 843 aa  216  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  28.64 
 
 		 938 aa  208  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  26.54 
 
 		 744 aa  207  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  26.63 
 
 		 702 aa  206  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  26.49 
 
 		 771 aa  205  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  27.83 
 
 		 931 aa  204  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.59 
 
 		 864 aa  204  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.81 
 
 		 837 aa  197  7e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  31.41 
 
 		 837 aa  196  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  27.53 
 
 		 935 aa  196  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 863 aa  196  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 743 aa  191  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 844 aa  190  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.54 
 
 		 849 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  26.5 
 
 		 814 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  26.02 
 
 		 817 aa  181  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  26.13 
 
 		 812 aa  180  8e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  26.79 
 
 		 853 aa  180  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  26 
 
 		 814 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  28.32 
 
 		 834 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 923 aa  155  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  28.75 
 
 		 904 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  27.86 
 
 		 884 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  26.01 
 
 		 668 aa  145  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  28.25 
 
 		 884 aa  144  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  28.23 
 
 		 914 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 852 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  27.91 
 
 		 880 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  29.44 
 
 		 977 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  29.27 
 
 		 909 aa  137  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 868 aa  136  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  28.11 
 
 		 894 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  26.38 
 
 		 869 aa  136  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 910 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  28.17 
 
 		 911 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 789 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 910 aa  135  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 911 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0571  DNA topoisomerase I  27.39 
 
 		 907 aa  134  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.600151  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  26.58 
 
 		 701 aa  134  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.51 
 
 		 700 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18080  DNA topoisomerase I  27.2 
 
 		 944 aa  133  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  26.77 
 
 		 900 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 913 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.73 
 
 		 700 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  27.63 
 
 		 695 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  26.55 
 
 		 885 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32680  DNA topoisomerase I  26.66 
 
 		 962 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 907 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  26.58 
 
 		 697 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  26.75 
 
 		 898 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  26.91 
 
 		 836 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  27.85 
 
 		 851 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  27.98 
 
 		 922 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  25.68 
 
 		 693 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  27.97 
 
 		 891 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 		 961 aa  131  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 700 aa  130  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 886 aa  130  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  27.26 
 
 		 926 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 869 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 869 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 869 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 891 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 869 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  27.77 
 
 		 893 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 849 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  25.62 
 
 		 760 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  25.63 
 
 		 911 aa  128  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 859 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 815 aa  129  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  27 
 
 		 857 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  26.55 
 
 		 849 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 		 824 aa  127  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 788 aa  127  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  27.4 
 
 		 815 aa  127  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 936 aa  127  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 830 aa  127  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  26.07 
 
 		 877 aa  127  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0575  DNA topoisomerase I  27.07 
 
 		 1031 aa  127  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 711 aa  127  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>