More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0109 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  100 
 
 		 610 aa  1246    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  51.63 
 
 		 604 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  52.57 
 
 		 596 aa  571  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  50.08 
 
 		 602 aa  568  1e-160  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  48.52 
 
 		 604 aa  548  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  47.53 
 
 		 631 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  36.73 
 
 		 780 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  33.44 
 
 		 855 aa  343  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  34.66 
 
 		 931 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  33.39 
 
 		 702 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  33.94 
 
 		 931 aa  299  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  33.01 
 
 		 747 aa  299  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  33.11 
 
 		 743 aa  291  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.39 
 
 		 849 aa  289  9e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  32.24 
 
 		 744 aa  289  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  33.08 
 
 		 1009 aa  287  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.67 
 
 		 938 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 771 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  32.56 
 
 		 942 aa  277  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  33.06 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  31.81 
 
 		 616 aa  274  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  31.82 
 
 		 834 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  31.69 
 
 		 837 aa  270  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  31.22 
 
 		 863 aa  270  8e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  33.72 
 
 		 863 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  31.2 
 
 		 935 aa  268  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  30.64 
 
 		 629 aa  266  5.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  31.6 
 
 		 837 aa  266  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 844 aa  263  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  29.87 
 
 		 843 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  33.28 
 
 		 868 aa  256  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 827 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  30.47 
 
 		 828 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.18 
 
 		 864 aa  246  8e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 853 aa  224  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  27.82 
 
 		 814 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  27.99 
 
 		 812 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 814 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  27.5 
 
 		 817 aa  208  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  27.56 
 
 		 668 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  26.52 
 
 		 691 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  26.52 
 
 		 691 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  25.94 
 
 		 706 aa  169  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  27.06 
 
 		 696 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  26.96 
 
 		 689 aa  166  9e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  25.39 
 
 		 714 aa  162  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1768  DNA topoisomerase I  26.44 
 
 		 968 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  25.89 
 
 		 695 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04911  DNA topoisomerase I  26.44 
 
 		 968 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.624674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  27.06 
 
 		 689 aa  157  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  25.58 
 
 		 874 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  26.64 
 
 		 700 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  28.11 
 
 		 872 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  26.85 
 
 		 700 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  26.81 
 
 		 868 aa  153  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  24.79 
 
 		 693 aa  154  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  27.56 
 
 		 697 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  27.23 
 
 		 691 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 		 691 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  26.47 
 
 		 700 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  24.83 
 
 		 708 aa  152  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  26.11 
 
 		 895 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  25.33 
 
 		 883 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  25.89 
 
 		 697 aa  150  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  27.76 
 
 		 704 aa  150  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  25.33 
 
 		 899 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  28.76 
 
 		 681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 702 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  28.48 
 
 		 701 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  24.15 
 
 		 694 aa  148  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  25.96 
 
 		 802 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  26.13 
 
 		 694 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  26.86 
 
 		 751 aa  147  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  24.66 
 
 		 765 aa  147  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2482  DNA topoisomerase I  25.64 
 
 		 720 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0421727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  26.35 
 
 		 691 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  25.55 
 
 		 706 aa  146  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 		 692 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  26.59 
 
 		 881 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3867  DNA topoisomerase I  26.48 
 
 		 720 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.442129 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0857  DNA topoisomerase I  26.7 
 
 		 848 aa  146  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 877 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 692 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 692 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 692 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 692 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  24.13 
 
 		 883 aa  145  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 877 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  27.16 
 
 		 721 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  26.89 
 
 		 867 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  24.3 
 
 		 780 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  27.78 
 
 		 868 aa  144  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  24.5 
 
 		 765 aa  144  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  26.89 
 
 		 798 aa  144  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 		 702 aa  143  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  26.25 
 
 		 804 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2304  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 871 aa  143  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.926517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  25.17 
 
 		 899 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  26.74 
 
 		 692 aa  143  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1923  DNA topoisomerase I  27.35 
 
 		 871 aa  143  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0924763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>