More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0752 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  100 
 
 
701 aa  1392    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  46.67 
 
 
799 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  49.79 
 
 
754 aa  618  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  43.68 
 
 
746 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  44.84 
 
 
695 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  46.39 
 
 
867 aa  561  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  51.72 
 
 
689 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 
906 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 
869 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  41.61 
 
 
908 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 
869 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  42.68 
 
 
839 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  42.16 
 
 
896 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 
869 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  41.94 
 
 
846 aa  538  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  42.31 
 
 
891 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 
869 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 
869 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 
869 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  41.34 
 
 
891 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  41.47 
 
 
865 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  41.47 
 
 
865 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  41.6 
 
 
865 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  41.47 
 
 
865 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  41.47 
 
 
865 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  41.6 
 
 
865 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  41.26 
 
 
876 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  41.04 
 
 
889 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  41.04 
 
 
888 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  41.45 
 
 
865 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  41.18 
 
 
854 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  41.54 
 
 
876 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  42.36 
 
 
718 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  41.4 
 
 
877 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  41.69 
 
 
981 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  41.83 
 
 
975 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  42.31 
 
 
982 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  42.94 
 
 
721 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  44.17 
 
 
729 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  41.27 
 
 
992 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  41.05 
 
 
990 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  41.69 
 
 
981 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  40.34 
 
 
876 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  40.03 
 
 
1002 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  39.14 
 
 
714 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  39.5 
 
 
920 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  40.86 
 
 
879 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  40.44 
 
 
980 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 
714 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 
714 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 
714 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 
714 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  40.11 
 
 
714 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 
714 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  40.11 
 
 
714 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  40.11 
 
 
714 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  39.97 
 
 
714 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  44.07 
 
 
686 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  39.92 
 
 
939 aa  490  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  41.32 
 
 
722 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  40.14 
 
 
920 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  39.7 
 
 
876 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  39.47 
 
 
714 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  40.39 
 
 
869 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  39.22 
 
 
731 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  39.64 
 
 
851 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  38.04 
 
 
873 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  37.01 
 
 
768 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  39.06 
 
 
731 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  38.2 
 
 
777 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  39.77 
 
 
675 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  38.43 
 
 
729 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  38.43 
 
 
729 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  38.43 
 
 
729 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  38.49 
 
 
729 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  38.43 
 
 
729 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  36.99 
 
 
719 aa  462  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  38.43 
 
 
729 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  38.78 
 
 
729 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  38.56 
 
 
729 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  37.72 
 
 
729 aa  458  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.97 
 
 
608 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  38.09 
 
 
729 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  38.43 
 
 
707 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  37.95 
 
 
729 aa  452  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  41.8 
 
 
697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  39.71 
 
 
620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  37.06 
 
 
712 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  35.86 
 
 
815 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  39.75 
 
 
730 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  39.54 
 
 
681 aa  426  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  35.43 
 
 
711 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  35.43 
 
 
711 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  38.5 
 
 
741 aa  414  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.41 
 
 
573 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  38.73 
 
 
697 aa  408  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  35.69 
 
 
711 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0072  DNA topoisomerase  34.26 
 
 
720 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2238  DNA topoisomerase  32.33 
 
 
720 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.735062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1950  DNA topoisomerase  32.19 
 
 
720 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>