More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0857 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0857  DNA topoisomerase I  100 
 
 
848 aa  1684    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  38.87 
 
 
874 aa  589  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  38.06 
 
 
858 aa  585  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  40.82 
 
 
883 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 
872 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  39.01 
 
 
883 aa  578  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  38.95 
 
 
899 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  41.25 
 
 
877 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  41.25 
 
 
877 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  38.82 
 
 
881 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  39.66 
 
 
910 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1768  DNA topoisomerase I  38.8 
 
 
968 aa  562  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04911  DNA topoisomerase I  40.31 
 
 
968 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.624674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  36.83 
 
 
895 aa  549  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  39.1 
 
 
899 aa  548  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  38.2 
 
 
898 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0605  DNA topoisomerase I  35.74 
 
 
954 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1765  DNA topoisomerase I  38.34 
 
 
899 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.125266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35810  DNA topoisomerase I  38.42 
 
 
921 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.203227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06301  DNA topoisomerase I  38.05 
 
 
916 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.059761 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1921  DNA topoisomerase I  37.11 
 
 
850 aa  525  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  37.15 
 
 
923 aa  519  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  38.75 
 
 
906 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  38.85 
 
 
891 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  38.72 
 
 
964 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  35.74 
 
 
913 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04981  DNA topoisomerase I  39.72 
 
 
870 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  36.83 
 
 
1023 aa  515  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0738  DNA topoisomerase I  36.55 
 
 
978 aa  512  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8444  DNA topoisomerase I  34.88 
 
 
944 aa  512  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0264145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  38.66 
 
 
883 aa  509  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  36.96 
 
 
946 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25040  DNA topoisomerase I  33.37 
 
 
963 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  38.97 
 
 
926 aa  505  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  37.59 
 
 
923 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0378  DNA topoisomerase I  37.68 
 
 
905 aa  505  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.381193  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04601  DNA topoisomerase I  40.82 
 
 
868 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  35.79 
 
 
1049 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  36.64 
 
 
912 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0435  DNA topoisomerase I  39.61 
 
 
868 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5182  DNA topoisomerase I  36.41 
 
 
957 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  36.53 
 
 
943 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4796  DNA topoisomerase I  36.41 
 
 
957 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32680  DNA topoisomerase I  33.84 
 
 
962 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4882  DNA topoisomerase I  36.41 
 
 
957 aa  498  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.010742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0571  DNA topoisomerase I  35.53 
 
 
907 aa  495  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.600151  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  37.95 
 
 
948 aa  495  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04911  DNA topoisomerase I  40.45 
 
 
868 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1394  DNA topoisomerase I  35.85 
 
 
941 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13675  DNA topoisomerase I  35.46 
 
 
934 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000348117  normal  0.0874905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5396  DNA topoisomerase I  35.94 
 
 
955 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585871  normal  0.0823046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3876  DNA topoisomerase I  35.82 
 
 
968 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  36.11 
 
 
904 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3355  DNA topoisomerase I  36.17 
 
 
911 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  35.87 
 
 
919 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  33.8 
 
 
924 aa  482  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4408  DNA topoisomerase I  36.62 
 
 
949 aa  482  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0487  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 
963 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957852  decreased coverage  0.00303001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18080  DNA topoisomerase I  34.21 
 
 
944 aa  465  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0575  DNA topoisomerase I  36.21 
 
 
1031 aa  452  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1276  topoisomerase I  34.21 
 
 
1028 aa  450  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  34.29 
 
 
915 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  38.38 
 
 
693 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  39.57 
 
 
691 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  33.56 
 
 
869 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  32.45 
 
 
909 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  32.99 
 
 
845 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  32.41 
 
 
913 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  35.51 
 
 
711 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  35.02 
 
 
820 aa  392  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  35.88 
 
 
751 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  32.81 
 
 
910 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  32.81 
 
 
910 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  34.91 
 
 
758 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  32.74 
 
 
936 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  31.49 
 
 
924 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  32.97 
 
 
911 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  38.16 
 
 
839 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  31.6 
 
 
894 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  32.49 
 
 
914 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  32.68 
 
 
760 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  32.23 
 
 
891 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  38.34 
 
 
703 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  41.72 
 
 
696 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  33.94 
 
 
816 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  35.67 
 
 
711 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  32.22 
 
 
911 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  32.03 
 
 
849 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 
849 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  36.25 
 
 
702 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  31.45 
 
 
888 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  34.29 
 
 
820 aa  379  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  33.24 
 
 
747 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  34.42 
 
 
697 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  31.22 
 
 
880 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  38.45 
 
 
703 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  34.47 
 
 
696 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  30.63 
 
 
851 aa  379  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  32.78 
 
 
884 aa  376  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  36.14 
 
 
789 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>