More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0575 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  45.07 
 
 		 858 aa  719    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  55.65 
 
 		 904 aa  980    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1921  DNA topoisomerase I  47.8 
 
 		 850 aa  734    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32680  DNA topoisomerase I  51.19 
 
 		 962 aa  821    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25040  DNA topoisomerase I  53.5 
 
 		 963 aa  988    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  56.09 
 
 		 1023 aa  914    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18080  DNA topoisomerase I  55.86 
 
 		 944 aa  993    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1394  DNA topoisomerase I  71.63 
 
 		 941 aa  1343    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  44.49 
 
 		 910 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  69.7 
 
 		 923 aa  1322    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35810  DNA topoisomerase I  63.48 
 
 		 921 aa  1120    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.203227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13675  DNA topoisomerase I  70.53 
 
 		 934 aa  1347    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000348117  normal  0.0874905 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  44.19 
 
 		 899 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  59.37 
 
 		 906 aa  1043    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1768  DNA topoisomerase I  45.67 
 
 		 968 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  57.17 
 
 		 913 aa  1024    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  45.23 
 
 		 881 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  60.52 
 
 		 891 aa  1066    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0487  DNA topoisomerase I  49.52 
 
 		 963 aa  793    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957852  decreased coverage  0.00303001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1765  DNA topoisomerase I  46.9 
 
 		 899 aa  691    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.125266  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  47.24 
 
 		 899 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8444  DNA topoisomerase I  58.35 
 
 		 944 aa  1022    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0264145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  45.75 
 
 		 883 aa  689    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0738  DNA topoisomerase I  66.77 
 
 		 978 aa  1189    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  43.78 
 
 		 883 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  53.67 
 
 		 1049 aa  909    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04911  DNA topoisomerase I  45.67 
 
 		 968 aa  714    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.624674 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  49.2 
 
 		 948 aa  842    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  46.5 
 
 		 877 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  51.23 
 
 		 964 aa  828    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  53.65 
 
 		 924 aa  860    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  58.6 
 
 		 926 aa  1009    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4796  DNA topoisomerase I  71.49 
 
 		 957 aa  1336    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  47.75 
 
 		 895 aa  713    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4408  DNA topoisomerase I  62.55 
 
 		 949 aa  872    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 874 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5182  DNA topoisomerase I  71.49 
 
 		 957 aa  1336    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  54.82 
 
 		 943 aa  913    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0575  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 1031 aa  2081    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  54.81 
 
 		 919 aa  888    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  45.04 
 
 		 872 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06301  DNA topoisomerase I  45.44 
 
 		 916 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.059761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0605  DNA topoisomerase I  56.78 
 
 		 954 aa  940    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  46.5 
 
 		 877 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3876  DNA topoisomerase I  69.17 
 
 		 968 aa  1275    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3355  DNA topoisomerase I  53.9 
 
 		 911 aa  967    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  52.84 
 
 		 923 aa  850    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  59.65 
 
 		 883 aa  1049    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0571  DNA topoisomerase I  53.76 
 
 		 907 aa  852    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.600151  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  52.95 
 
 		 898 aa  856    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1276  topoisomerase I  52.23 
 
 		 1028 aa  719    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  58.91 
 
 		 946 aa  1069    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0378  DNA topoisomerase I  58.89 
 
 		 905 aa  1008    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.381193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4882  DNA topoisomerase I  71.49 
 
 		 957 aa  1336    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.010742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  53.96 
 
 		 912 aa  974    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5396  DNA topoisomerase I  71.99 
 
 		 955 aa  1349    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585871  normal  0.0823046 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04981  DNA topoisomerase I  43.4 
 
 		 870 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04911  DNA topoisomerase I  44.14 
 
 		 868 aa  635  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0435  DNA topoisomerase I  44.37 
 
 		 868 aa  632  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04601  DNA topoisomerase I  43.81 
 
 		 868 aa  632  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.56 
 
 		 711 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  37.54 
 
 		 857 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  35.65 
 
 		 885 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  41.21 
 
 		 825 aa  487  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  41.04 
 
 		 835 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  35.97 
 
 		 977 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  41.38 
 
 		 797 aa  482  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  37.43 
 
 		 857 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  40.81 
 
 		 758 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  41.67 
 
 		 834 aa  478  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  35.82 
 
 		 914 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  41.52 
 
 		 757 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  41.06 
 
 		 758 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  40.26 
 
 		 841 aa  472  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  41.95 
 
 		 854 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  35.92 
 
 		 894 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  42.4 
 
 		 836 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  40.66 
 
 		 839 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  39.48 
 
 		 756 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  37.72 
 
 		 816 aa  465  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  41.7 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  42.16 
 
 		 789 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  35.94 
 
 		 911 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  35.23 
 
 		 961 aa  462  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  38.9 
 
 		 783 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  41.49 
 
 		 824 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  43.46 
 
 		 703 aa  459  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  36.56 
 
 		 880 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  35.64 
 
 		 904 aa  459  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  38.52 
 
 		 845 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  44.81 
 
 		 853 aa  458  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  39.34 
 
 		 849 aa  459  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  39.92 
 
 		 792 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  43.12 
 
 		 703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  36.44 
 
 		 911 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  42.27 
 
 		 841 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  45.18 
 
 		 793 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  36.72 
 
 		 915 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  41.09 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  40.99 
 
 		 894 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>