More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0738 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  60.73 
 
 		 946 aa  1078    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13675  DNA topoisomerase I  69.07 
 
 		 934 aa  1244    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000348117  normal  0.0874905 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04981  DNA topoisomerase I  45.01 
 
 		 870 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  64.37 
 
 		 883 aa  1077    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0738  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 978 aa  1955    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  61.45 
 
 		 943 aa  1058    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5182  DNA topoisomerase I  70.46 
 
 		 957 aa  1239    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3876  DNA topoisomerase I  65.4 
 
 		 968 aa  1132    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  62.93 
 
 		 891 aa  1100    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  46.91 
 
 		 899 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  64.12 
 
 		 1023 aa  1111    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  48.15 
 
 		 895 aa  778    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  60.41 
 
 		 926 aa  1008    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  48.57 
 
 		 877 aa  747    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  63.33 
 
 		 906 aa  1054    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1768  DNA topoisomerase I  45.88 
 
 		 968 aa  740    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0605  DNA topoisomerase I  64.27 
 
 		 954 aa  1120    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  48.65 
 
 		 881 aa  753    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  69.63 
 
 		 923 aa  1254    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4408  DNA topoisomerase I  61.45 
 
 		 949 aa  1055    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  48.57 
 
 		 877 aa  746    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1765  DNA topoisomerase I  49.38 
 
 		 899 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.125266  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  48.38 
 
 		 899 aa  736    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  52.15 
 
 		 948 aa  855    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8444  DNA topoisomerase I  58.79 
 
 		 944 aa  990    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0264145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  47.98 
 
 		 883 aa  763    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  57.28 
 
 		 904 aa  970    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0435  DNA topoisomerase I  44.89 
 
 		 868 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  49.1 
 
 		 883 aa  758    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35810  DNA topoisomerase I  69.37 
 
 		 921 aa  1234    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.203227 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1276  topoisomerase I  50 
 
 		 1028 aa  820    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  60.4 
 
 		 1049 aa  1106    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25040  DNA topoisomerase I  53.48 
 
 		 963 aa  933    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0571  DNA topoisomerase I  59.65 
 
 		 907 aa  974    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.600151  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32680  DNA topoisomerase I  56.38 
 
 		 962 aa  966    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  59.72 
 
 		 924 aa  994    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  57.73 
 
 		 923 aa  981    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04911  DNA topoisomerase I  45.78 
 
 		 968 aa  739    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.624674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  55.75 
 
 		 912 aa  952    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  56 
 
 		 964 aa  946    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1921  DNA topoisomerase I  52.95 
 
 		 850 aa  854    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4796  DNA topoisomerase I  70.46 
 
 		 957 aa  1239    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04601  DNA topoisomerase I  44.89 
 
 		 868 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  46.77 
 
 		 910 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  47.43 
 
 		 874 aa  768    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0575  DNA topoisomerase I  66.6 
 
 		 1031 aa  1205    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  61.12 
 
 		 919 aa  1038    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0487  DNA topoisomerase I  56.57 
 
 		 963 aa  934    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957852  decreased coverage  0.00303001 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04911  DNA topoisomerase I  44.78 
 
 		 868 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425235  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06301  DNA topoisomerase I  49.1 
 
 		 916 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.059761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  48.94 
 
 		 872 aa  789    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3355  DNA topoisomerase I  55.47 
 
 		 911 aa  939    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  49.21 
 
 		 858 aa  760    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  59.91 
 
 		 913 aa  1004    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1394  DNA topoisomerase I  70.57 
 
 		 941 aa  1254    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  60.54 
 
 		 898 aa  1013    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18080  DNA topoisomerase I  56.99 
 
 		 944 aa  959    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0378  DNA topoisomerase I  62.49 
 
 		 905 aa  1012    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.381193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4882  DNA topoisomerase I  70.46 
 
 		 957 aa  1239    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.010742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5396  DNA topoisomerase I  70.26 
 
 		 955 aa  1254    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585871  normal  0.0823046 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  39.98 
 
 		 849 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  38.62 
 
 		 894 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  37.67 
 
 		 901 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  40.42 
 
 		 851 aa  535  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  39.1 
 
 		 896 aa  531  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  37.4 
 
 		 845 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  37.77 
 
 		 909 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  38.74 
 
 		 904 aa  524  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  38.12 
 
 		 914 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  39.73 
 
 		 880 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  39.08 
 
 		 849 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  38.88 
 
 		 913 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  38.62 
 
 		 888 aa  515  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  37.84 
 
 		 915 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  38.08 
 
 		 910 aa  515  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  38.08 
 
 		 910 aa  516  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  39.35 
 
 		 852 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  44.39 
 
 		 711 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  37.19 
 
 		 869 aa  510  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  37.82 
 
 		 857 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  38.99 
 
 		 911 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  38.06 
 
 		 885 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  38.21 
 
 		 911 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  38.88 
 
 		 884 aa  502  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  37.77 
 
 		 894 aa  502  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  38.88 
 
 		 884 aa  502  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  38.65 
 
 		 911 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  37.41 
 
 		 884 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  37.71 
 
 		 877 aa  499  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  38.03 
 
 		 914 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  38.07 
 
 		 936 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  37.14 
 
 		 884 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  35.33 
 
 		 816 aa  494  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  38.85 
 
 		 922 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 877 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0857  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 848 aa  492  1e-137  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  37.46 
 
 		 867 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  39.14 
 
 		 859 aa  485  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  38.9 
 
 		 797 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  47.68 
 
 		 789 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>