More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1133 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  45.86 
 
 		 909 aa  761    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  46.29 
 
 		 904 aa  776    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  44.26 
 
 		 852 aa  698    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  48.81 
 
 		 768 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 816 aa  1681    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  47.7 
 
 		 851 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  47.29 
 
 		 924 aa  769    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  48.09 
 
 		 877 aa  804    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  43.95 
 
 		 884 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  46.25 
 
 		 914 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  48.38 
 
 		 894 aa  800    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  60.75 
 
 		 820 aa  1018    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  44.46 
 
 		 857 aa  687    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  48.26 
 
 		 911 aa  768    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  42.98 
 
 		 783 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  43.95 
 
 		 884 aa  698    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  42.68 
 
 		 900 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  43.1 
 
 		 854 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  45.56 
 
 		 888 aa  761    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  46.34 
 
 		 891 aa  762    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  47.7 
 
 		 851 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  48.41 
 
 		 915 aa  817    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  45.86 
 
 		 910 aa  762    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  48.44 
 
 		 885 aa  808    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  48.02 
 
 		 911 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  44.3 
 
 		 859 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0594  DNA topoisomerase I  46.12 
 
 		 827 aa  728    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  60.71 
 
 		 820 aa  1013    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  41.69 
 
 		 907 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  48.86 
 
 		 922 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  46.78 
 
 		 845 aa  722    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  47.78 
 
 		 914 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  48.13 
 
 		 936 aa  760    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  46.92 
 
 		 913 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  46.14 
 
 		 884 aa  774    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  48.2 
 
 		 896 aa  780    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  44.15 
 
 		 893 aa  701    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  45.62 
 
 		 849 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  46.6 
 
 		 849 aa  776    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  46.37 
 
 		 884 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  45.58 
 
 		 977 aa  745    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  41.6 
 
 		 797 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  45.29 
 
 		 867 aa  734    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  44.51 
 
 		 894 aa  737    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  47.31 
 
 		 911 aa  762    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  45.86 
 
 		 910 aa  762    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  47.08 
 
 		 961 aa  775    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  44.24 
 
 		 880 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  43.96 
 
 		 823 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  46.27 
 
 		 851 aa  731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  47.53 
 
 		 916 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  47.73 
 
 		 877 aa  796    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  45.48 
 
 		 869 aa  743    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  47 
 
 		 901 aa  772    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  46.36 
 
 		 783 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  47.37 
 
 		 759 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  47.18 
 
 		 759 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 834 aa  617  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41359  predicted protein  41.79 
 
 		 840 aa  609  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  48.3 
 
 		 758 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  42.32 
 
 		 815 aa  598  1e-170  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  48.51 
 
 		 758 aa  601  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  43.92 
 
 		 799 aa  599  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  47.12 
 
 		 776 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  44.92 
 
 		 765 aa  598  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  42.2 
 
 		 815 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  44.78 
 
 		 765 aa  592  1e-168  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  41.66 
 
 		 824 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  47.33 
 
 		 757 aa  592  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  47.47 
 
 		 756 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  43.19 
 
 		 836 aa  587  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  46.19 
 
 		 779 aa  586  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  46.77 
 
 		 779 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 789 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  42.15 
 
 		 830 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  43.76 
 
 		 841 aa  568  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  46.38 
 
 		 711 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  44.19 
 
 		 793 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  42.78 
 
 		 780 aa  555  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  46.62 
 
 		 710 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 767 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  45.37 
 
 		 696 aa  540  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  47.33 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  46.24 
 
 		 711 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  44.6 
 
 		 694 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 		 703 aa  537  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  45.25 
 
 		 703 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  44.2 
 
 		 697 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  46.78 
 
 		 702 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  45.34 
 
 		 751 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  41.57 
 
 		 853 aa  535  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 		 703 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  43.96 
 
 		 859 aa  529  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  42.74 
 
 		 894 aa  532  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  45.96 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  46.07 
 
 		 692 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  42.43 
 
 		 758 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  38.19 
 
 		 872 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  46.54 
 
 		 692 aa  525  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  44.67 
 
 		 691 aa  525  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>