More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0594 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  43.27 
 
 		 904 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  42.54 
 
 		 884 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  41.33 
 
 		 891 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 		 914 aa  686    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  46.12 
 
 		 816 aa  728    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  42.27 
 
 		 877 aa  682    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  41.55 
 
 		 901 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 		 820 aa  742    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  39.59 
 
 		 909 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  40.61 
 
 		 913 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  42.72 
 
 		 885 aa  686    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  40.7 
 
 		 924 aa  656    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  41.53 
 
 		 896 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  42.42 
 
 		 884 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  40.94 
 
 		 915 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0594  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 827 aa  1708    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  45.7 
 
 		 820 aa  742    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  39.74 
 
 		 888 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 		 849 aa  679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  41.8 
 
 		 877 aa  674    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  43.34 
 
 		 867 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  41.06 
 
 		 894 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  40.96 
 
 		 869 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  39.9 
 
 		 911 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  39.61 
 
 		 910 aa  631  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  39.88 
 
 		 911 aa  632  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  39.61 
 
 		 910 aa  630  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  39.31 
 
 		 936 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  39.95 
 
 		 922 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  39.67 
 
 		 914 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  39.67 
 
 		 911 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  42.91 
 
 		 845 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  39.67 
 
 		 961 aa  620  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  40.57 
 
 		 977 aa  620  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  38.93 
 
 		 894 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  39.64 
 
 		 916 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  41.75 
 
 		 851 aa  611  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  40.07 
 
 		 880 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  39.61 
 
 		 900 aa  599  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  40.38 
 
 		 884 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  40.29 
 
 		 783 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  40.38 
 
 		 884 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  39.35 
 
 		 849 aa  590  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  39.37 
 
 		 893 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  37.84 
 
 		 907 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  44.26 
 
 		 768 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  40.1 
 
 		 854 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  39.47 
 
 		 852 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  38.7 
 
 		 857 aa  569  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  38.8 
 
 		 859 aa  572  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  42.64 
 
 		 759 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  42.78 
 
 		 759 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  38.94 
 
 		 797 aa  561  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  42.77 
 
 		 756 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  39.28 
 
 		 799 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  42.42 
 
 		 783 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  40.32 
 
 		 823 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  43.3 
 
 		 765 aa  548  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41359  predicted protein  40.44 
 
 		 840 aa  548  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  43.09 
 
 		 765 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  39.4 
 
 		 815 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  39.45 
 
 		 815 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  42.5 
 
 		 851 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  42.5 
 
 		 851 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  41.64 
 
 		 841 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 758 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  38.48 
 
 		 824 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  38.49 
 
 		 836 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  42.11 
 
 		 758 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  38.5 
 
 		 834 aa  524  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  41.05 
 
 		 757 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  42.9 
 
 		 779 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  39.43 
 
 		 780 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  38.5 
 
 		 830 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.41 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  40.9 
 
 		 776 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  42.44 
 
 		 779 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  39.65 
 
 		 789 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  40.47 
 
 		 743 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  39.8 
 
 		 793 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  43.22 
 
 		 693 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  41.64 
 
 		 691 aa  492  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  38.43 
 
 		 767 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  41.18 
 
 		 696 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  42.45 
 
 		 684 aa  484  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  41.24 
 
 		 700 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  40.63 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  40.93 
 
 		 700 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  41.71 
 
 		 710 aa  479  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  40.63 
 
 		 703 aa  474  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  42.45 
 
 		 706 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  40.82 
 
 		 696 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  40.63 
 
 		 703 aa  475  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  40.94 
 
 		 700 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  41.75 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  40.24 
 
 		 695 aa  476  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  42 
 
 		 702 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  41.59 
 
 		 704 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  40.98 
 
 		 694 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  40.51 
 
 		 711 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>