More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1645 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  54.35 
 
 
880 aa  883    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  55.13 
 
 
910 aa  947    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  100 
 
 
924 aa  1872    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  48.9 
 
 
768 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  47.37 
 
 
816 aa  777    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  55.29 
 
 
877 aa  940    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  54.39 
 
 
914 aa  937    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  55.37 
 
 
961 aa  915    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  55.75 
 
 
877 aa  949    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  55.45 
 
 
916 aa  878    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  55.09 
 
 
909 aa  960    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  55.52 
 
 
888 aa  942    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  47.71 
 
 
823 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  49.16 
 
 
765 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  46.59 
 
 
820 aa  799    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  46.98 
 
 
857 aa  722    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  55.21 
 
 
911 aa  905    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  46.57 
 
 
783 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  55.13 
 
 
910 aa  949    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  54.3 
 
 
884 aa  873    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  53.6 
 
 
884 aa  915    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  56.65 
 
 
896 aa  929    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  56.06 
 
 
885 aa  954    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  62.32 
 
 
915 aa  1063    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  55.74 
 
 
904 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  55.03 
 
 
911 aa  893    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  52.38 
 
 
859 aa  819    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0594  DNA topoisomerase I  40.23 
 
 
827 aa  664    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  46.72 
 
 
820 aa  808    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  49.89 
 
 
907 aa  830    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  48.22 
 
 
854 aa  651    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  54.91 
 
 
922 aa  877    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  47.26 
 
 
845 aa  756    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  54.3 
 
 
884 aa  873    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  54.79 
 
 
914 aa  883    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  56.34 
 
 
901 aa  946    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  54.98 
 
 
936 aa  901    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  43.4 
 
 
815 aa  675    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  50.63 
 
 
893 aa  854    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  53.82 
 
 
849 aa  844    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  56.79 
 
 
894 aa  969    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  55.18 
 
 
849 aa  937    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  49.66 
 
 
900 aa  831    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  49.02 
 
 
765 aa  654    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  53.53 
 
 
851 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  50.86 
 
 
869 aa  890    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  55.38 
 
 
911 aa  910    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  55.07 
 
 
852 aa  850    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  44.91 
 
 
797 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41359  predicted protein  48.07 
 
 
840 aa  655    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  55.88 
 
 
913 aa  942    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  53.71 
 
 
867 aa  897    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  54.61 
 
 
977 aa  894    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  43.51 
 
 
815 aa  678    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  53.73 
 
 
884 aa  922    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  50.3 
 
 
783 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  46.89 
 
 
834 aa  645    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  53.53 
 
 
851 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  53.34 
 
 
851 aa  863    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  73.63 
 
 
891 aa  1264    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  55.54 
 
 
894 aa  924    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  45.29 
 
 
799 aa  632  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  46.18 
 
 
824 aa  631  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  47.87 
 
 
776 aa  628  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  45.01 
 
 
830 aa  622  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  49.63 
 
 
759 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  49.63 
 
 
759 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  46.54 
 
 
756 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  50.16 
 
 
758 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  50.23 
 
 
757 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  50 
 
 
758 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  46.09 
 
 
779 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  47.83 
 
 
841 aa  588  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  45.6 
 
 
779 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  39.22 
 
 
874 aa  559  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  46.04 
 
 
836 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  46.19 
 
 
789 aa  552  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  39.67 
 
 
923 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  39.05 
 
 
895 aa  548  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0571  DNA topoisomerase I  40.79 
 
 
907 aa  549  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.600151  hitchhiker  0.00349746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  38.99 
 
 
881 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  38.31 
 
 
872 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  38.81 
 
 
910 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  39.2 
 
 
883 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  39.06 
 
 
877 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  39.07 
 
 
913 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  45.27 
 
 
711 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  39.06 
 
 
877 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  45.43 
 
 
780 aa  532  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  38.77 
 
 
904 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  37.43 
 
 
883 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  39.02 
 
 
1023 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 
912 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  42.95 
 
 
691 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  45.92 
 
 
696 aa  525  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  43.93 
 
 
691 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  41.84 
 
 
831 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  41.84 
 
 
831 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  44.95 
 
 
793 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  41.62 
 
 
831 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>