More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2030 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  55.12 
 
 		 780 aa  832    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  54.25 
 
 		 825 aa  880    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  50.06 
 
 		 788 aa  726    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  53.07 
 
 		 784 aa  816    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  53.21 
 
 		 857 aa  896    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  51.78 
 
 		 841 aa  835    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  51.55 
 
 		 835 aa  769    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  58.8 
 
 		 841 aa  919    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  51.3 
 
 		 839 aa  829    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  64.3 
 
 		 792 aa  1016    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 894 aa  1828    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  43.44 
 
 		 834 aa  600  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  42.18 
 
 		 824 aa  582  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  42.46 
 
 		 854 aa  572  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  41.54 
 
 		 797 aa  572  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  41.48 
 
 		 830 aa  569  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  41.06 
 
 		 783 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  41.36 
 
 		 823 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  41.61 
 
 		 815 aa  562  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 		 799 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  41.48 
 
 		 815 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  38.37 
 
 		 884 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  38.26 
 
 		 884 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  37.92 
 
 		 914 aa  535  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  36.88 
 
 		 961 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  38.32 
 
 		 901 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  38 
 
 		 885 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  39.25 
 
 		 849 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  38.4 
 
 		 867 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  37.68 
 
 		 964 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  37.51 
 
 		 849 aa  522  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  37.11 
 
 		 977 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  36.27 
 
 		 869 aa  513  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  38.74 
 
 		 1023 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  37.8 
 
 		 911 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  36.73 
 
 		 894 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  37.87 
 
 		 909 aa  512  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  38.31 
 
 		 910 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  38.31 
 
 		 910 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 877 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  37.6 
 
 		 872 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  38.23 
 
 		 936 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  37.22 
 
 		 880 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  37.87 
 
 		 888 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  37.54 
 
 		 924 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.43 
 
 		 711 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  37.87 
 
 		 911 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  37.98 
 
 		 923 aa  505  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  37.17 
 
 		 877 aa  501  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  38.32 
 
 		 913 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  38.08 
 
 		 883 aa  502  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  37.05 
 
 		 915 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  37.06 
 
 		 896 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  38.03 
 
 		 922 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  37.54 
 
 		 914 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  37.34 
 
 		 895 aa  500  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  37.44 
 
 		 851 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  37.9 
 
 		 881 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  36.48 
 
 		 904 aa  499  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  37.49 
 
 		 911 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  38.73 
 
 		 859 aa  499  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  36.59 
 
 		 883 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  36.48 
 
 		 891 aa  498  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  37.31 
 
 		 884 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  36.86 
 
 		 884 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0605  DNA topoisomerase I  35.95 
 
 		 954 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  36.16 
 
 		 1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  36 
 
 		 893 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  36.71 
 
 		 891 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  41.9 
 
 		 793 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  37.49 
 
 		 894 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  37.75 
 
 		 926 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32680  DNA topoisomerase I  36.7 
 
 		 962 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  36.56 
 
 		 923 aa  489  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  38.03 
 
 		 852 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  37.62 
 
 		 898 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  42.84 
 
 		 776 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  38.6 
 
 		 857 aa  485  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  37.46 
 
 		 916 aa  485  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  37.95 
 
 		 845 aa  485  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  42.47 
 
 		 696 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5396  DNA topoisomerase I  36.34 
 
 		 955 aa  485  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585871  normal  0.0823046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  37.08 
 
 		 904 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 912 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  37.8 
 
 		 877 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  41.8 
 
 		 697 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  37.8 
 
 		 877 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  35.94 
 
 		 910 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18080  DNA topoisomerase I  36.38 
 
 		 944 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1394  DNA topoisomerase I  36.13 
 
 		 941 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  41.64 
 
 		 756 aa  479  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  42.43 
 
 		 758 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  37.25 
 
 		 919 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  36.32 
 
 		 943 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  36.32 
 
 		 946 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13675  DNA topoisomerase I  35.81 
 
 		 934 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000348117  normal  0.0874905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  41.64 
 
 		 836 aa  479  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  35.87 
 
 		 913 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35810  DNA topoisomerase I  35.78 
 
 		 921 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.203227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0378  DNA topoisomerase I  36.36 
 
 		 905 aa  479  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.381193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>