More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2343 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  53.14 
 
 		 788 aa  783    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  55.09 
 
 		 825 aa  808    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  57.16 
 
 		 839 aa  829    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  56.72 
 
 		 784 aa  838    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  62.44 
 
 		 792 aa  965    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  55.48 
 
 		 835 aa  850    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  60.71 
 
 		 857 aa  899    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  56.1 
 
 		 894 aa  932    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  58.88 
 
 		 780 aa  929    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 841 aa  1708    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  57.01 
 
 		 841 aa  828    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 		 834 aa  622  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  43.86 
 
 		 799 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  45.02 
 
 		 797 aa  617  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  43.18 
 
 		 854 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  43.47 
 
 		 830 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  42.96 
 
 		 815 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  43.25 
 
 		 815 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 783 aa  601  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  44.54 
 
 		 824 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  43.98 
 
 		 823 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  38.15 
 
 		 869 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  39.64 
 
 		 880 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  40.31 
 
 		 845 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  39.04 
 
 		 961 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  38.57 
 
 		 893 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  38.6 
 
 		 977 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  37.97 
 
 		 901 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.25 
 
 		 711 aa  522  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  37.46 
 
 		 884 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  38.88 
 
 		 849 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  37.46 
 
 		 884 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  42.13 
 
 		 758 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  37.44 
 
 		 849 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  38.37 
 
 		 857 aa  512  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  42.9 
 
 		 758 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  37.9 
 
 		 858 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  42.1 
 
 		 783 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  36.58 
 
 		 894 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  37.53 
 
 		 895 aa  508  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  37.69 
 
 		 1049 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  36.69 
 
 		 904 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0605  DNA topoisomerase I  39.34 
 
 		 954 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  37.81 
 
 		 859 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  41.6 
 
 		 756 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  36.41 
 
 		 867 aa  505  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  36.82 
 
 		 909 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  40.58 
 
 		 924 aa  505  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  40.41 
 
 		 768 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  37.26 
 
 		 913 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  36.98 
 
 		 896 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  38.88 
 
 		 1023 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  42.26 
 
 		 757 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  37.13 
 
 		 877 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  37.36 
 
 		 885 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  36.39 
 
 		 914 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  41.91 
 
 		 841 aa  498  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  42.25 
 
 		 779 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  37.05 
 
 		 964 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  36.08 
 
 		 884 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  39.51 
 
 		 851 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  36.16 
 
 		 910 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  36.18 
 
 		 891 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  36.35 
 
 		 884 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  42.5 
 
 		 789 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  39.72 
 
 		 793 aa  496  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  37.01 
 
 		 877 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  43.45 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 911 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  36.16 
 
 		 910 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 914 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  36.28 
 
 		 911 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  39.51 
 
 		 851 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  40.53 
 
 		 946 aa  495  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  42.05 
 
 		 776 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  38.62 
 
 		 923 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  41.48 
 
 		 836 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  36.44 
 
 		 911 aa  492  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  40.79 
 
 		 943 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  36.67 
 
 		 936 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  37.54 
 
 		 874 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  42.38 
 
 		 779 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  39.39 
 
 		 923 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  39.23 
 
 		 883 aa  488  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  37.54 
 
 		 883 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  37.07 
 
 		 852 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  39.11 
 
 		 891 aa  488  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  39.22 
 
 		 906 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  35.92 
 
 		 915 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  35.92 
 
 		 888 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  36.85 
 
 		 922 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  38.69 
 
 		 877 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  38.69 
 
 		 877 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  43.49 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  43.49 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  38.74 
 
 		 904 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  42.64 
 
 		 710 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 		 691 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  35.87 
 
 		 910 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  38.76 
 
 		 881 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>