More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0754 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 788 aa  1621    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  55.11 
 
 		 857 aa  807    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  52.43 
 
 		 841 aa  781    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  49.94 
 
 		 835 aa  724    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  54.59 
 
 		 792 aa  810    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  49.81 
 
 		 894 aa  738    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  52.88 
 
 		 841 aa  793    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  53.64 
 
 		 784 aa  781    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  52.28 
 
 		 839 aa  752    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  53.57 
 
 		 825 aa  773    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  50.51 
 
 		 780 aa  764    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  42.89 
 
 		 815 aa  582  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  42.18 
 
 		 830 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  42.77 
 
 		 815 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  43.27 
 
 		 824 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  42.08 
 
 		 834 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  41.5 
 
 		 854 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  42.03 
 
 		 797 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  41.83 
 
 		 799 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  41.56 
 
 		 783 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  40.94 
 
 		 823 aa  545  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  38.28 
 
 		 915 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  36.38 
 
 		 849 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  36.7 
 
 		 885 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  37.28 
 
 		 857 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  38.01 
 
 		 904 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  35.95 
 
 		 884 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  35.21 
 
 		 893 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  36.67 
 
 		 867 aa  485  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  41.61 
 
 		 758 aa  482  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  35.47 
 
 		 877 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  35.76 
 
 		 894 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  36.98 
 
 		 845 aa  482  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.14 
 
 		 711 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  36.31 
 
 		 896 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  37.32 
 
 		 872 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 691 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  35.46 
 
 		 914 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  37 
 
 		 858 aa  478  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  36.07 
 
 		 901 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  37.6 
 
 		 900 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  35.23 
 
 		 904 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  36.03 
 
 		 852 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  40.99 
 
 		 758 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  36.79 
 
 		 891 aa  475  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  35.41 
 
 		 877 aa  475  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  35.36 
 
 		 884 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  37.06 
 
 		 851 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  35.75 
 
 		 923 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  37.24 
 
 		 906 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  35.41 
 
 		 961 aa  472  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  36.19 
 
 		 859 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  37 
 
 		 964 aa  470  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  38.19 
 
 		 913 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  43.19 
 
 		 756 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  40.73 
 
 		 776 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  43.26 
 
 		 757 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35810  DNA topoisomerase I  37.84 
 
 		 921 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.203227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  38.88 
 
 		 1023 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 689 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  35.78 
 
 		 883 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  41.82 
 
 		 779 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  35.1 
 
 		 849 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  42.52 
 
 		 695 aa  463  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  42.73 
 
 		 779 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  41.69 
 
 		 693 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  41.27 
 
 		 703 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 		 789 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 884 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 884 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  37.7 
 
 		 880 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  44.08 
 
 		 836 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  33.89 
 
 		 869 aa  462  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  37.8 
 
 		 926 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  38.33 
 
 		 898 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  36.89 
 
 		 911 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  40.97 
 
 		 703 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  34.86 
 
 		 883 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  36.76 
 
 		 877 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  35.23 
 
 		 911 aa  458  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  41.41 
 
 		 710 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  43.35 
 
 		 697 aa  459  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  36.76 
 
 		 877 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  35.56 
 
 		 914 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  35.23 
 
 		 936 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  44.05 
 
 		 793 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  35.97 
 
 		 874 aa  459  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  34.85 
 
 		 891 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.35 
 
 		 711 aa  459  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  41.34 
 
 		 700 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  37.25 
 
 		 943 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  36.55 
 
 		 881 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  43.1 
 
 		 841 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  36.47 
 
 		 911 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  37.77 
 
 		 919 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  36.9 
 
 		 922 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  42.57 
 
 		 751 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  41.03 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  42.95 
 
 		 691 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>