More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1150 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  51.37 
 
 		 788 aa  756    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  55.63 
 
 		 894 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  51.63 
 
 		 825 aa  769    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  51.63 
 
 		 839 aa  759    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  59.34 
 
 		 792 aa  934    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  53.74 
 
 		 835 aa  818    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  54.76 
 
 		 784 aa  800    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  58.88 
 
 		 841 aa  925    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  44.79 
 
 		 834 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  56.28 
 
 		 857 aa  857    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 780 aa  1608    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  52.74 
 
 		 841 aa  804    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  43.35 
 
 		 823 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  43.35 
 
 		 797 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  44.58 
 
 		 799 aa  625  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  43.43 
 
 		 854 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  42.68 
 
 		 783 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  43.22 
 
 		 815 aa  595  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  43.22 
 
 		 815 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  42.8 
 
 		 830 aa  596  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  42.82 
 
 		 824 aa  586  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  39.22 
 
 		 845 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  39.79 
 
 		 857 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.84 
 
 		 711 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  37.38 
 
 		 867 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  37.31 
 
 		 961 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  37.76 
 
 		 880 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  37.18 
 
 		 884 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  36.66 
 
 		 849 aa  510  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  37.17 
 
 		 849 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  37.18 
 
 		 884 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  36.47 
 
 		 858 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  35.94 
 
 		 904 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  36.13 
 
 		 884 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  36.21 
 
 		 914 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  36.02 
 
 		 884 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  36.36 
 
 		 915 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  37.75 
 
 		 910 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  37.75 
 
 		 910 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  37.21 
 
 		 893 aa  505  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  36.55 
 
 		 869 aa  505  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  37.59 
 
 		 909 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  36.51 
 
 		 901 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  38.07 
 
 		 859 aa  498  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  35.71 
 
 		 885 aa  499  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  38.26 
 
 		 911 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  36.99 
 
 		 895 aa  495  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 888 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  42.64 
 
 		 793 aa  495  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  35.69 
 
 		 894 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  36.11 
 
 		 977 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  35.21 
 
 		 877 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  37.84 
 
 		 936 aa  491  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  37.51 
 
 		 964 aa  491  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  42.51 
 
 		 783 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  42.35 
 
 		 700 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  37.8 
 
 		 922 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  44.76 
 
 		 836 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  36.99 
 
 		 894 aa  489  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  37.05 
 
 		 852 aa  486  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  42.19 
 
 		 700 aa  485  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  36.24 
 
 		 896 aa  485  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  41.68 
 
 		 758 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  36.3 
 
 		 883 aa  485  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 911 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  43.14 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 914 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  37.29 
 
 		 911 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  41.38 
 
 		 776 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  37.33 
 
 		 851 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  42.53 
 
 		 851 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  42.07 
 
 		 757 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  43.19 
 
 		 692 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  43.7 
 
 		 751 aa  480  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  36.14 
 
 		 916 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 841 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  34.76 
 
 		 877 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  42.53 
 
 		 851 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  42.51 
 
 		 779 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  38.96 
 
 		 756 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  44.32 
 
 		 789 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  45.41 
 
 		 702 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  42.22 
 
 		 779 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  42.02 
 
 		 695 aa  477  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  43.81 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  40.64 
 
 		 758 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  42.57 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  42.41 
 
 		 692 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  42.57 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 877 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  42.57 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 877 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  42.57 
 
 		 692 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  42.04 
 
 		 700 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  42.92 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  36.18 
 
 		 924 aa  475  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  42.55 
 
 		 695 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  42.26 
 
 		 692 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  37.6 
 
 		 872 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  42.26 
 
 		 692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>