More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00715 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  52.61 
 
 		 780 aa  798    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  52.43 
 
 		 788 aa  764    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  59.51 
 
 		 857 aa  966    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 841 aa  1713    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  56.16 
 
 		 784 aa  825    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  51.78 
 
 		 894 aa  823    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  52.93 
 
 		 835 aa  763    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  56.6 
 
 		 792 aa  835    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  57.01 
 
 		 841 aa  818    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  63.64 
 
 		 825 aa  1100    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  69.79 
 
 		 839 aa  1169    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  44.85 
 
 		 854 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  44.24 
 
 		 834 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  43.11 
 
 		 823 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  44.18 
 
 		 797 aa  598  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  43.44 
 
 		 799 aa  596  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  45.84 
 
 		 815 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  45.84 
 
 		 815 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  44.57 
 
 		 824 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  43.4 
 
 		 830 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  43.93 
 
 		 783 aa  582  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  37.57 
 
 		 913 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  39.75 
 
 		 946 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  43.16 
 
 		 757 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  37.8 
 
 		 910 aa  529  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  37.45 
 
 		 961 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  37.17 
 
 		 888 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  37.69 
 
 		 910 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  38.63 
 
 		 885 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  39.5 
 
 		 964 aa  528  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  37.42 
 
 		 909 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  39.15 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  43.02 
 
 		 758 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  43.96 
 
 		 711 aa  525  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  42.42 
 
 		 776 aa  525  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  37.91 
 
 		 894 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  38.58 
 
 		 884 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  38.25 
 
 		 884 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  36.67 
 
 		 977 aa  522  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  39.46 
 
 		 883 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  45.17 
 
 		 756 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  38.18 
 
 		 880 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  43.43 
 
 		 758 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  45.18 
 
 		 841 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  37.11 
 
 		 891 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  37.66 
 
 		 901 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  36.21 
 
 		 914 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  37.74 
 
 		 877 aa  514  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  37.2 
 
 		 849 aa  515  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  37.1 
 
 		 1049 aa  512  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  38.73 
 
 		 845 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  37.61 
 
 		 849 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  37.63 
 
 		 877 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  36.89 
 
 		 851 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  37.23 
 
 		 894 aa  512  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  37.27 
 
 		 923 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  37.43 
 
 		 895 aa  506  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3355  DNA topoisomerase I  37.92 
 
 		 911 aa  509  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  41.55 
 
 		 783 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 		 689 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  38.92 
 
 		 883 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  45.44 
 
 		 789 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  36.64 
 
 		 884 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  35.56 
 
 		 867 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  41.3 
 
 		 779 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  36.23 
 
 		 884 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  44.6 
 
 		 692 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  37.67 
 
 		 896 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  36.05 
 
 		 904 aa  502  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  44.94 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  37.73 
 
 		 914 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 		 710 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  40.89 
 
 		 779 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  38.14 
 
 		 898 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  36.59 
 
 		 869 aa  499  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  37.31 
 
 		 899 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  37.29 
 
 		 899 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  36.6 
 
 		 924 aa  497  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  35.83 
 
 		 893 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  38.21 
 
 		 872 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  43.99 
 
 		 692 aa  499  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  43.64 
 
 		 691 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  44.14 
 
 		 692 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  43.03 
 
 		 693 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  44.89 
 
 		 836 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  44.29 
 
 		 692 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  44.14 
 
 		 692 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  37.8 
 
 		 911 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  37.08 
 
 		 911 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  38.15 
 
 		 936 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  37.72 
 
 		 874 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  37.2 
 
 		 911 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  39.08 
 
 		 919 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  44.14 
 
 		 692 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>