More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1210 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  54.91 
 
 		 839 aa  791    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  58.75 
 
 		 780 aa  923    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  54.63 
 
 		 788 aa  788    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  64.3 
 
 		 894 aa  1001    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  54.92 
 
 		 835 aa  818    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 792 aa  1618    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  45.24 
 
 		 834 aa  637    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  56.6 
 
 		 841 aa  835    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  62.44 
 
 		 841 aa  951    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  57.64 
 
 		 857 aa  871    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  56.12 
 
 		 825 aa  819    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  57.33 
 
 		 784 aa  850    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  45.86 
 
 		 854 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  45.49 
 
 		 797 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  44.74 
 
 		 783 aa  621  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  44.48 
 
 		 815 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  44.83 
 
 		 823 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  44.65 
 
 		 830 aa  611  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  44.36 
 
 		 815 aa  612  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  45.12 
 
 		 824 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 799 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  37.84 
 
 		 849 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  38.52 
 
 		 880 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  38.13 
 
 		 851 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  38.39 
 
 		 877 aa  535  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  37.28 
 
 		 894 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  36.67 
 
 		 869 aa  530  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  38.28 
 
 		 877 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  36.92 
 
 		 914 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  39.76 
 
 		 845 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  38.3 
 
 		 885 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  37.16 
 
 		 904 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  38.34 
 
 		 884 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  38.18 
 
 		 964 aa  523  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  38.49 
 
 		 849 aa  525  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  38.52 
 
 		 867 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  38.34 
 
 		 884 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  37.75 
 
 		 891 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  37.13 
 
 		 884 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  36.81 
 
 		 893 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  36.79 
 
 		 884 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  37.38 
 
 		 883 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  40.85 
 
 		 756 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  41.49 
 
 		 776 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  37.53 
 
 		 913 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  39.39 
 
 		 881 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  42.96 
 
 		 841 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3914  DNA topoisomerase I  37.54 
 
 		 901 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  36.99 
 
 		 961 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  44.38 
 
 		 711 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  37.87 
 
 		 1023 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3160  DNA topoisomerase I  36.14 
 
 		 907 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.973259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3309  DNA topoisomerase I  37.09 
 
 		 888 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  37 
 
 		 910 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  37.78 
 
 		 896 aa  505  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  45.14 
 
 		 779 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  41.32 
 
 		 758 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  38.08 
 
 		 859 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  44.99 
 
 		 779 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  43.19 
 
 		 793 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  44.65 
 
 		 758 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  44.7 
 
 		 757 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  38.29 
 
 		 926 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  37.56 
 
 		 911 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  38.06 
 
 		 922 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  36.02 
 
 		 891 aa  498  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  39.61 
 
 		 894 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  37.44 
 
 		 914 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  37.54 
 
 		 898 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  38.27 
 
 		 906 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  38.15 
 
 		 895 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  37.71 
 
 		 857 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  36.84 
 
 		 911 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  37.09 
 
 		 1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  37.43 
 
 		 936 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  41.68 
 
 		 789 aa  496  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0657  DNA topoisomerase I  35.8 
 
 		 913 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  43.71 
 
 		 697 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  44.21 
 
 		 836 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  37.25 
 
 		 911 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  36.63 
 
 		 852 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  37.28 
 
 		 977 aa  489  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  36.1 
 
 		 915 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0605  DNA topoisomerase I  39.15 
 
 		 954 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  38.32 
 
 		 924 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1137  DNA topoisomerase I  37.29 
 
 		 900 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  39.06 
 
 		 904 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  37.49 
 
 		 899 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  42.61 
 
 		 710 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  44.88 
 
 		 693 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  37.4 
 
 		 883 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3876  DNA topoisomerase I  38.4 
 
 		 968 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 		 783 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  36.92 
 
 		 899 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32680  DNA topoisomerase I  36.71 
 
 		 962 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  42.92 
 
 		 696 aa  482  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1765  DNA topoisomerase I  38.18 
 
 		 899 aa  479  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.125266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1921  DNA topoisomerase I  37.22 
 
 		 850 aa  476  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  43.12 
 
 		 780 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  39.64 
 
 		 767 aa  475  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>