More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0839 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  100 
 
 		 681 aa  1363    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1027  DNA topoisomerase type IA central domain protein  42.66 
 
 		 775 aa  515  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  39.54 
 
 		 701 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  36.86 
 
 		 799 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 746 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  34.68 
 
 		 867 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  34.86 
 
 		 695 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  36.89 
 
 		 680 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  38.59 
 
 		 697 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  37.06 
 
 		 722 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  33.06 
 
 		 714 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  35.21 
 
 		 768 aa  359  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  38.06 
 
 		 721 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  34.41 
 
 		 839 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  31.94 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  357  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  357  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  37.87 
 
 		 729 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  34.72 
 
 		 718 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 		 854 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  34.23 
 
 		 846 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  34.94 
 
 		 889 aa  350  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  38.72 
 
 		 689 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  34.94 
 
 		 888 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  33.65 
 
 		 865 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  37.66 
 
 		 686 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  33.11 
 
 		 865 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  35.22 
 
 		 873 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  33.11 
 
 		 865 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  34.13 
 
 		 754 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  36.88 
 
 		 675 aa  341  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 891 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 908 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 869 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 906 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 869 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 869 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  32.97 
 
 		 865 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 869 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 869 aa  340  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 869 aa  340  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  32.97 
 
 		 865 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  32.97 
 
 		 865 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  32.97 
 
 		 865 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  32.78 
 
 		 729 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.83 
 
 		 608 aa  337  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1738  DNA topoisomerase III  34.55 
 
 		 699 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  37.11 
 
 		 679 aa  336  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  34.23 
 
 		 712 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  34 
 
 		 851 aa  335  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  36.21 
 
 		 620 aa  334  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  37.27 
 
 		 679 aa  334  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  33.53 
 
 		 729 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1425  DNA topoisomerase III  34.21 
 
 		 683 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.771336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  33.96 
 
 		 891 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 719 aa  331  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 896 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  36.18 
 
 		 684 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 729 aa  329  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  34.28 
 
 		 731 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  32.76 
 
 		 920 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  35.09 
 
 		 707 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 876 aa  326  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 876 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  34.11 
 
 		 731 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  33.07 
 
 		 877 aa  324  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  32.61 
 
 		 876 aa  323  5e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1433  DNA topoisomerase III  36.45 
 
 		 706 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1498  DNA topoisomerase III  36.35 
 
 		 732 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.82 
 
 		 573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  31.28 
 
 		 689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1486  DNA topoisomerase III  35.75 
 
 		 704 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.892881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  37.29 
 
 		 744 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  34.25 
 
 		 676 aa  318  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  34.75 
 
 		 669 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1966  DNA topoisomerase III  38.27 
 
 		 640 aa  317  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2478  DNA topoisomerase III  33.97 
 
 		 662 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  34.7 
 
 		 652 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1630  DNA topoisomerase III  35.1 
 
 		 647 aa  316  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168302  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  35.02 
 
 		 654 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2753  DNA topoisomerase III  35.42 
 
 		 705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1310  DNA topoisomerase III  35.29 
 
 		 632 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00570993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2736  DNA topoisomerase III  35.42 
 
 		 705 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2830  DNA topoisomerase III  35.26 
 
 		 705 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1623  DNA topoisomerase III  35.26 
 
 		 705 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.730482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>