More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47417 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  100 
 
 		 1009 aa  2106    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  38.31 
 
 		 828 aa  444  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  40.72 
 
 		 629 aa  442  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  37.58 
 
 		 616 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  36.26 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  34.29 
 
 		 863 aa  347  6e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  31.83 
 
 		 868 aa  343  9e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.08 
 
 		 610 aa  287  7e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  31.34 
 
 		 855 aa  280  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  32.99 
 
 		 602 aa  273  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  32.79 
 
 		 780 aa  270  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  31.91 
 
 		 596 aa  258  5e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  34.01 
 
 		 604 aa  253  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  31.34 
 
 		 631 aa  251  5e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.25 
 
 		 604 aa  249  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  25.77 
 
 		 837 aa  221  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  27.81 
 
 		 744 aa  207  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  26.44 
 
 		 837 aa  206  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  26.81 
 
 		 843 aa  206  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  27 
 
 		 844 aa  204  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  27.75 
 
 		 747 aa  201  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  27.31 
 
 		 931 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  27.76 
 
 		 702 aa  199  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  24.94 
 
 		 863 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  26.27 
 
 		 827 aa  197  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  28.3 
 
 		 834 aa  193  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  25.1 
 
 		 849 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  25.6 
 
 		 942 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  26.04 
 
 		 864 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  25.52 
 
 		 771 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  26.67 
 
 		 931 aa  184  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  26.03 
 
 		 935 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  24.85 
 
 		 743 aa  183  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  25.12 
 
 		 938 aa  180  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  23.44 
 
 		 817 aa  154  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  27.51 
 
 		 872 aa  152  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  23.06 
 
 		 814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  21.88 
 
 		 812 aa  148  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  22.81 
 
 		 814 aa  146  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  26.4 
 
 		 879 aa  146  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2657  DNA topoisomerase I  25.19 
 
 		 865 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000104499  unclonable  0.0000000870588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  28.1 
 
 		 722 aa  145  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  27.74 
 
 		 865 aa  144  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.15 
 
 		 868 aa  142  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  25 
 
 		 867 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  26.49 
 
 		 876 aa  142  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  25.38 
 
 		 868 aa  142  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 865 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  26.2 
 
 		 693 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  26.73 
 
 		 896 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  24.72 
 
 		 876 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  26.77 
 
 		 889 aa  140  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1923  DNA topoisomerase I  24.58 
 
 		 871 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0924763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  25.69 
 
 		 876 aa  139  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2033  DNA topoisomerase I  24.58 
 
 		 871 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2304  DNA topoisomerase I  24.58 
 
 		 871 aa  139  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.926517  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 865 aa  138  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 865 aa  138  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 865 aa  138  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  25.64 
 
 		 865 aa  138  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  25.86 
 
 		 865 aa  138  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 865 aa  138  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 865 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 865 aa  138  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 865 aa  137  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 865 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 865 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 865 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 865 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  26.14 
 
 		 880 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  26.46 
 
 		 886 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  25.64 
 
 		 884 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1803  DNA topoisomerase I  26.49 
 
 		 906 aa  135  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0789615  hitchhiker  0.0000387309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  26.48 
 
 		 895 aa  135  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  25.1 
 
 		 879 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  26.34 
 
 		 894 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2343  DNA topoisomerase III  25.34 
 
 		 641 aa  134  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000133374  normal  0.0757376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  26.14 
 
 		 894 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2088  DNA topoisomerase III  25.34 
 
 		 642 aa  134  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00112487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1979  DNA topoisomerase III  25.34 
 
 		 641 aa  134  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  26.47 
 
 		 880 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  26.47 
 
 		 880 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  26.47 
 
 		 880 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  26.54 
 
 		 708 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  26.14 
 
 		 894 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  26.47 
 
 		 880 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  25.94 
 
 		 878 aa  132  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  25.32 
 
 		 884 aa  132  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  26.19 
 
 		 898 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  23.01 
 
 		 853 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2208  DNA topoisomerase III  25.37 
 
 		 641 aa  131  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.948709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  25.1 
 
 		 866 aa  131  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  26.16 
 
 		 880 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  25.04 
 
 		 895 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  27.05 
 
 		 877 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2718  DNA topoisomerase III  24.32 
 
 		 641 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94815  hitchhiker  0.00169428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  24.35 
 
 		 668 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  25.43 
 
 		 883 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  25.4 
 
 		 866 aa  128  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  24.14 
 
 		 768 aa  127  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>