More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33842 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  100 
 
 		 641 aa  1338    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  37.68 
 
 		 828 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  38.03 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  36.26 
 
 		 1009 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  34.99 
 
 		 616 aa  371  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  36.48 
 
 		 863 aa  339  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  32.59 
 
 		 868 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  33.17 
 
 		 631 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.06 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.06 
 
 		 855 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.84 
 
 		 604 aa  264  4e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.46 
 
 		 780 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  32.5 
 
 		 602 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  34.06 
 
 		 596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.83 
 
 		 604 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  30.78 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 747 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  28.44 
 
 		 837 aa  214  4.9999999999999996e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  30.43 
 
 		 931 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 827 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.14 
 
 		 849 aa  200  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  26.79 
 
 		 931 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  27.43 
 
 		 834 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  28.32 
 
 		 843 aa  193  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  27.26 
 
 		 942 aa  193  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 844 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  28.9 
 
 		 837 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  27.77 
 
 		 935 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 744 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 863 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  26.17 
 
 		 771 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.99 
 
 		 938 aa  171  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  25.24 
 
 		 743 aa  169  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.97 
 
 		 864 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  26.51 
 
 		 812 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  25.09 
 
 		 817 aa  146  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  24.78 
 
 		 853 aa  146  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  25.8 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  25 
 
 		 814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  27.2 
 
 		 707 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  26.29 
 
 		 719 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  25.59 
 
 		 697 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  25.75 
 
 		 744 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  26.25 
 
 		 668 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  26.47 
 
 		 701 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  25.04 
 
 		 722 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  24.55 
 
 		 731 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  24.27 
 
 		 731 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  24.36 
 
 		 768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  26.23 
 
 		 721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  23.74 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  25.18 
 
 		 679 aa  112  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 757 aa  111  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  24.92 
 
 		 799 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  25.28 
 
 		 679 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  23.54 
 
 		 831 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  26.73 
 
 		 868 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  23.54 
 
 		 831 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  23.78 
 
 		 831 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  24.34 
 
 		 894 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  25.61 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 849 aa  108  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  25.23 
 
 		 654 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  24.8 
 
 		 729 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  24.02 
 
 		 712 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  22.61 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  25.35 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  23.58 
 
 		 669 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  25.8 
 
 		 758 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  25.36 
 
 		 693 aa  104  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  22.62 
 
 		 693 aa  104  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  25.35 
 
 		 653 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  26.17 
 
 		 681 aa  103  7e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  22.61 
 
 		 700 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  25.81 
 
 		 696 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  25.91 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  25.51 
 
 		 652 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  25.38 
 
 		 830 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  22.41 
 
 		 700 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  25.91 
 
 		 815 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  23.83 
 
 		 802 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  24.13 
 
 		 824 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  25.91 
 
 		 852 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  24.96 
 
 		 899 aa  101  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  23.75 
 
 		 714 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  23.19 
 
 		 895 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  24.22 
 
 		 869 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  25.51 
 
 		 910 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  25.24 
 
 		 868 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  24.85 
 
 		 756 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  24.53 
 
 		 671 aa  98.6  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  25.05 
 
 		 868 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  23.86 
 
 		 813 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  24.32 
 
 		 877 aa  98.2  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  27.03 
 
 		 689 aa  97.8  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  24.39 
 
 		 697 aa  97.8  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  25.74 
 
 		 655 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  24.65 
 
 		 869 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  24.65 
 
 		 869 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  24.65 
 
 		 869 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>