More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1451 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  56.25 
 
 		 873 aa  737    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 620 aa  1283    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  42.25 
 
 		 754 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  39.08 
 
 		 721 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  40.75 
 
 		 865 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  41.07 
 
 		 865 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  39.71 
 
 		 701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  39.24 
 
 		 799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 869 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 869 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 869 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 906 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 869 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 869 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 869 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  40.26 
 
 		 891 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 865 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 865 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 865 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 865 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  40.42 
 
 		 865 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  38.72 
 
 		 722 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  40.58 
 
 		 889 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  40.58 
 
 		 888 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  40.26 
 
 		 877 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  38.68 
 
 		 920 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  39.77 
 
 		 908 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1318  DNA topoisomerase III  56.12 
 
 		 805 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000791242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  39.02 
 
 		 695 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  40.13 
 
 		 891 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  38.68 
 
 		 876 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  39.94 
 
 		 896 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  39.77 
 
 		 846 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  38.36 
 
 		 729 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  40.36 
 
 		 876 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  37.52 
 
 		 746 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  39.58 
 
 		 854 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  38.66 
 
 		 939 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  40.58 
 
 		 851 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  40.19 
 
 		 876 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0943  DNA topoisomerase III  53.87 
 
 		 862 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.513939  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  38.27 
 
 		 867 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  38.64 
 
 		 768 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  38.36 
 
 		 686 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  39.87 
 
 		 879 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  39.02 
 
 		 839 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  39.94 
 
 		 1002 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  39.62 
 
 		 982 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  37.25 
 
 		 729 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  37.4 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  37.4 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  37.25 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  37.4 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  39.44 
 
 		 980 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  38.74 
 
 		 981 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  37.4 
 
 		 729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  36.21 
 
 		 729 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  37.4 
 
 		 729 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  40.37 
 
 		 608 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  37.25 
 
 		 729 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  39.12 
 
 		 975 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 729 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  38.74 
 
 		 981 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  36.93 
 
 		 729 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  39.25 
 
 		 990 aa  402  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  39.38 
 
 		 876 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  38.41 
 
 		 992 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  38.3 
 
 		 675 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  38.17 
 
 		 712 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  37.52 
 
 		 719 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  36.44 
 
 		 731 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  39.04 
 
 		 869 aa  386  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  38.36 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  37.98 
 
 		 920 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  37.4 
 
 		 730 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  36.44 
 
 		 731 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  37.46 
 
 		 679 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  37.06 
 
 		 679 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  36.62 
 
 		 671 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  35.95 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  35.9 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  37.52 
 
 		 741 aa  363  6e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  33.07 
 
 		 711 aa  360  3e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  36.26 
 
 		 744 aa  361  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  35.84 
 
 		 670 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  35.78 
 
 		 670 aa  360  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  35.62 
 
 		 671 aa  359  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  35.28 
 
 		 777 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  36.16 
 
 		 666 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  35.25 
 
 		 655 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  35.66 
 
 		 653 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  35.04 
 
 		 673 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  34.45 
 
 		 697 aa  356  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  35.82 
 
 		 653 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  34.69 
 
 		 680 aa  355  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  35.97 
 
 		 676 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  35.97 
 
 		 676 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  35.22 
 
 		 714 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  35.2 
 
 		 670 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  35.22 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>