More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0229 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  44.6 
 
 		 869 aa  703    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 869 aa  1148    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 865 aa  1155    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  66.4 
 
 		 877 aa  1135    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  46.34 
 
 		 939 aa  724    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 869 aa  1149    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  68.55 
 
 		 981 aa  1230    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  61.48 
 
 		 839 aa  1033    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  66.28 
 
 		 908 aa  1146    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  65.91 
 
 		 896 aa  1130    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 906 aa  1148    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 869 aa  1148    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  61.4 
 
 		 920 aa  1076    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  67.09 
 
 		 865 aa  1162    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  76.6 
 
 		 879 aa  1391    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 876 aa  1805    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  57.68 
 
 		 846 aa  988    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  66.9 
 
 		 891 aa  1146    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  67.56 
 
 		 865 aa  1164    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  62.67 
 
 		 876 aa  1082    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  65.7 
 
 		 1002 aa  1196    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  66.03 
 
 		 992 aa  1177    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  67.09 
 
 		 888 aa  1158    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  66.98 
 
 		 865 aa  1162    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  66.97 
 
 		 891 aa  1142    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 869 aa  1149    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  66.98 
 
 		 865 aa  1162    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 869 aa  1149    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 889 aa  1156    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  67.49 
 
 		 975 aa  1221    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 865 aa  1154    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  67.51 
 
 		 876 aa  1156    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  66.98 
 
 		 865 aa  1162    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  58.8 
 
 		 854 aa  1012    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  67.79 
 
 		 980 aa  1210    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  68.25 
 
 		 982 aa  1218    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  66.26 
 
 		 990 aa  1181    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  67.63 
 
 		 876 aa  1158    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  68.4 
 
 		 981 aa  1218    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  66.86 
 
 		 869 aa  1149    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  65.06 
 
 		 920 aa  1172    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  46.4 
 
 		 851 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  37.76 
 
 		 815 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  42.32 
 
 		 754 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  37.05 
 
 		 799 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  39.7 
 
 		 701 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  38.65 
 
 		 695 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  36.21 
 
 		 867 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  40.77 
 
 		 729 aa  445  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  39.43 
 
 		 721 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  40.66 
 
 		 686 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 746 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  40.33 
 
 		 873 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  37.52 
 
 		 689 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  37.36 
 
 		 722 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  39.38 
 
 		 620 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  38.21 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  37.74 
 
 		 729 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 729 aa  393  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  37.24 
 
 		 729 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  37.09 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  37.09 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  36.94 
 
 		 729 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  37.09 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  37.09 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  37.44 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  36.94 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  37.08 
 
 		 729 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  34.15 
 
 		 731 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  35.87 
 
 		 730 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  34.18 
 
 		 777 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  34.42 
 
 		 731 aa  372  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  34.41 
 
 		 718 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  35.83 
 
 		 719 aa  356  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  32.29 
 
 		 768 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  34.95 
 
 		 707 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  33.51 
 
 		 675 aa  346  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  33.16 
 
 		 714 aa  346  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  33.03 
 
 		 714 aa  340  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  33.03 
 
 		 714 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  33.03 
 
 		 714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  32.42 
 
 		 714 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  32.9 
 
 		 714 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  32.9 
 
 		 714 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  33.03 
 
 		 714 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  32.9 
 
 		 714 aa  337  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  32.42 
 
 		 714 aa  336  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  33.7 
 
 		 712 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.9 
 
 		 573 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  33.25 
 
 		 714 aa  327  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  32.76 
 
 		 741 aa  325  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  33.98 
 
 		 680 aa  325  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  34.33 
 
 		 711 aa  321  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  34.33 
 
 		 711 aa  321  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  34.98 
 
 		 608 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  33.64 
 
 		 697 aa  313  1e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  32.26 
 
 		 676 aa  313  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  32.26 
 
 		 676 aa  313  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  32.71 
 
 		 671 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4792  DNA topoisomerase III  30.05 
 
 		 649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>