More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2001 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 721 aa  1493    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  51 
 
 		 729 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  51.72 
 
 		 729 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  51 
 
 		 729 aa  709    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  51 
 
 		 729 aa  709    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  51 
 
 		 729 aa  708    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  51 
 
 		 729 aa  709    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  51.43 
 
 		 729 aa  715    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  51 
 
 		 729 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  50.29 
 
 		 697 aa  660    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  51 
 
 		 729 aa  708    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  51.8 
 
 		 731 aa  710    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  52.52 
 
 		 731 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  51.43 
 
 		 729 aa  716    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  60.31 
 
 		 686 aa  800    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  51.72 
 
 		 729 aa  723    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  51.98 
 
 		 730 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  58.17 
 
 		 729 aa  801    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  57.12 
 
 		 722 aa  797    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  43.34 
 
 		 711 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  43.34 
 
 		 711 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  43.05 
 
 		 711 aa  540  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  42.31 
 
 		 746 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  42.94 
 
 		 701 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  43.93 
 
 		 695 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  42.33 
 
 		 891 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  44.11 
 
 		 799 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  42.17 
 
 		 896 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  42.43 
 
 		 877 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  41.97 
 
 		 876 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  42.28 
 
 		 876 aa  492  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  40.6 
 
 		 754 aa  487  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  41.3 
 
 		 865 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  41.3 
 
 		 865 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 865 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 865 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  41.3 
 
 		 865 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 869 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 869 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 869 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  40.99 
 
 		 891 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 865 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 906 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  41.46 
 
 		 908 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 869 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 869 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 869 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  40.68 
 
 		 865 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  42.46 
 
 		 846 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  41.15 
 
 		 889 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  40.99 
 
 		 888 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  40.89 
 
 		 876 aa  479  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  41.24 
 
 		 854 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  41.22 
 
 		 839 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  39.85 
 
 		 867 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  41.39 
 
 		 873 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  40.12 
 
 		 920 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  43.25 
 
 		 608 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  40.85 
 
 		 981 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  39.85 
 
 		 1002 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  41.21 
 
 		 975 aa  458  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  40.7 
 
 		 981 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 992 aa  452  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  43.16 
 
 		 719 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  39.08 
 
 		 620 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  39.49 
 
 		 990 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  38.89 
 
 		 939 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  40.21 
 
 		 879 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  40.18 
 
 		 982 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  41.13 
 
 		 707 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  40.28 
 
 		 768 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  42.11 
 
 		 712 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  39.37 
 
 		 920 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  39.29 
 
 		 876 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 675 aa  433  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  39.38 
 
 		 980 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  44.32 
 
 		 689 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  38.29 
 
 		 851 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  39.75 
 
 		 697 aa  409  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  34.34 
 
 		 744 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  34.18 
 
 		 730 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  36.59 
 
 		 655 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  36.63 
 
 		 654 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  37.17 
 
 		 670 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  37.06 
 
 		 679 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  37.13 
 
 		 666 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  34.56 
 
 		 815 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  38.29 
 
 		 654 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  35.55 
 
 		 777 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  36.62 
 
 		 671 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  37.52 
 
 		 718 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  37.46 
 
 		 653 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  36.93 
 
 		 869 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  37.46 
 
 		 652 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  37.08 
 
 		 653 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  35.74 
 
 		 655 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  36.59 
 
 		 679 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  35.23 
 
 		 684 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.63 
 
 		 573 aa  389  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1738  DNA topoisomerase III  35.54 
 
 		 699 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>