More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2322 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  48.35 
 
 		 729 aa  700    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 711 aa  1479    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  72.86 
 
 		 711 aa  1088    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  48.35 
 
 		 729 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  48.21 
 
 		 729 aa  702    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  48.21 
 
 		 729 aa  702    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  48.07 
 
 		 729 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  48.21 
 
 		 729 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  48.07 
 
 		 729 aa  697    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  48.21 
 
 		 729 aa  702    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  44.15 
 
 		 729 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  47.05 
 
 		 731 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  47.46 
 
 		 731 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  48.48 
 
 		 729 aa  708    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  48.07 
 
 		 729 aa  701    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  46.69 
 
 		 730 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 711 aa  1479    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  48.21 
 
 		 729 aa  702    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  42.74 
 
 		 722 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  43.34 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  43.3 
 
 		 697 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  41.87 
 
 		 686 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  37.85 
 
 		 799 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  35.43 
 
 		 701 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  36.03 
 
 		 746 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  36.19 
 
 		 695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  35.05 
 
 		 754 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  35.34 
 
 		 676 aa  381  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.98 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  32.48 
 
 		 671 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  33.23 
 
 		 670 aa  359  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  34.93 
 
 		 939 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  35.94 
 
 		 846 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 869 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 869 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 869 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  36.11 
 
 		 712 aa  356  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 869 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 869 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 906 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 869 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  35.31 
 
 		 896 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  35.47 
 
 		 891 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  35.22 
 
 		 908 aa  354  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  32.02 
 
 		 654 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  32.47 
 
 		 655 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  35.37 
 
 		 876 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  35.22 
 
 		 891 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  35.01 
 
 		 876 aa  352  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  33.53 
 
 		 675 aa  351  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  35.64 
 
 		 889 aa  351  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  35.16 
 
 		 888 aa  350  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  36.36 
 
 		 768 aa  349  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  35.05 
 
 		 877 aa  349  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  33.69 
 
 		 707 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  34.91 
 
 		 865 aa  348  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  35.17 
 
 		 719 aa  348  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  31.51 
 
 		 670 aa  347  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  33.7 
 
 		 867 aa  347  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  34.59 
 
 		 865 aa  347  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  34.75 
 
 		 865 aa  346  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  34.59 
 
 		 865 aa  346  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 		 680 aa  346  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  31.02 
 
 		 655 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 670 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  35.09 
 
 		 920 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  30.87 
 
 		 671 aa  344  4e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  34.8 
 
 		 865 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  34.8 
 
 		 865 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  35.11 
 
 		 982 aa  343  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  34.8 
 
 		 865 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  30.13 
 
 		 730 aa  343  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  34.78 
 
 		 876 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  31.21 
 
 		 744 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  32 
 
 		 679 aa  342  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  30.72 
 
 		 671 aa  342  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  31.09 
 
 		 676 aa  341  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  31.09 
 
 		 676 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  32.41 
 
 		 620 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  31.83 
 
 		 670 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  31.62 
 
 		 673 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  31.16 
 
 		 666 aa  340  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  35.83 
 
 		 689 aa  340  5.9999999999999996e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  33.89 
 
 		 992 aa  340  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  35.01 
 
 		 879 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  31.6 
 
 		 679 aa  339  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 854 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  31.67 
 
 		 670 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  33.14 
 
 		 707 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  30.42 
 
 		 671 aa  335  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  33.59 
 
 		 839 aa  333  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  33.74 
 
 		 975 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  30.22 
 
 		 680 aa  333  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  30.8 
 
 		 669 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0033  putative DNA topoisomerase III  33.74 
 
 		 815 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  31.01 
 
 		 650 aa  332  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  37.1 
 
 		 689 aa  331  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  34.18 
 
 		 1002 aa  331  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  31.77 
 
 		 722 aa  331  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  34.4 
 
 		 981 aa  331  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>