More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1822 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  100 
 
 		 573 aa  1159    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  38.41 
 
 		 701 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  38.85 
 
 		 729 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  38.98 
 
 		 722 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  39.74 
 
 		 730 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  38.96 
 
 		 729 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  39.04 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  39.04 
 
 		 729 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  39.46 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  38.54 
 
 		 729 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  38.63 
 
 		 721 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  38.7 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  38.7 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  38.7 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  38.87 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  38.7 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  39.56 
 
 		 731 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  38.31 
 
 		 729 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  38.7 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  36.98 
 
 		 867 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  38.1 
 
 		 719 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  39.36 
 
 		 731 aa  382  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  38 
 
 		 799 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  38.33 
 
 		 697 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  37.04 
 
 		 891 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  35.61 
 
 		 939 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  37.77 
 
 		 712 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 869 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  37.98 
 
 		 711 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 906 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  37.71 
 
 		 707 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  38.08 
 
 		 768 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 869 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  37.26 
 
 		 839 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 869 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 869 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  35.95 
 
 		 620 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 869 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  36.29 
 
 		 854 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  37.98 
 
 		 711 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 869 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  35.82 
 
 		 675 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  36.95 
 
 		 877 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  37.24 
 
 		 896 aa  369  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  36.14 
 
 		 865 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  36.87 
 
 		 891 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  35.12 
 
 		 873 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  35.35 
 
 		 865 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  36.87 
 
 		 876 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  37.03 
 
 		 876 aa  365  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  36.64 
 
 		 888 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  36.6 
 
 		 889 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.2 
 
 		 608 aa  364  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 865 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  35.07 
 
 		 865 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 865 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  35.07 
 
 		 865 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 865 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  35.77 
 
 		 908 aa  359  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  36.47 
 
 		 741 aa  358  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  38.62 
 
 		 711 aa  357  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  36.48 
 
 		 920 aa  356  5.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  36.07 
 
 		 846 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  34.85 
 
 		 754 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  34.66 
 
 		 876 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  35.5 
 
 		 695 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  35.62 
 
 		 697 aa  347  5e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  33.88 
 
 		 718 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  37.54 
 
 		 689 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  34.01 
 
 		 990 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0351  topoisomerase III  35.05 
 
 		 719 aa  331  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  34.07 
 
 		 975 aa  330  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  33.89 
 
 		 744 aa  329  8e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  33.54 
 
 		 982 aa  329  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  35.31 
 
 		 714 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  33.75 
 
 		 980 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  34.23 
 
 		 981 aa  325  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  33.18 
 
 		 992 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  33.9 
 
 		 876 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  35.81 
 
 		 714 aa  323  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  32.87 
 
 		 1002 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  33.91 
 
 		 981 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  37.82 
 
 		 681 aa  322  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  321  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  32.74 
 
 		 730 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  319  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 714 aa  319  9e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  31.81 
 
 		 671 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  32.86 
 
 		 879 aa  318  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  33.7 
 
 		 920 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  31.36 
 
 		 655 aa  316  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0093  topoisomerase IA  34.41 
 
 		 722 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  31.96 
 
 		 650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  32.91 
 
 		 869 aa  305  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>