More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0351 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0351  topoisomerase III  100 
 
 		 719 aa  1478    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  40.68 
 
 		 741 aa  475  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  35.44 
 
 		 799 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  35.73 
 
 		 701 aa  360  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  35.94 
 
 		 722 aa  354  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  35.61 
 
 		 721 aa  350  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  32.21 
 
 		 695 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  33.03 
 
 		 718 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 867 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  34.74 
 
 		 729 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  35.05 
 
 		 573 aa  331  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  35.95 
 
 		 697 aa  329  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  37.21 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  33.13 
 
 		 731 aa  324  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  34.09 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  32.83 
 
 		 731 aa  321  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  32.53 
 
 		 729 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  33 
 
 		 686 aa  318  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  31.16 
 
 		 714 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  32.42 
 
 		 729 aa  317  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  32.98 
 
 		 729 aa  316  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  32.88 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 729 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 729 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 729 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 729 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  32.72 
 
 		 729 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 		 729 aa  313  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  33.07 
 
 		 846 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  30.94 
 
 		 768 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  32.86 
 
 		 839 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 697 aa  307  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  31.96 
 
 		 714 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  31.82 
 
 		 714 aa  307  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  31.82 
 
 		 714 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 714 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 714 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 714 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 714 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  31.57 
 
 		 711 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  31.57 
 
 		 711 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  31.56 
 
 		 714 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  32.24 
 
 		 754 aa  300  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0072  DNA topoisomerase  30.34 
 
 		 720 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  31.91 
 
 		 714 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  32.56 
 
 		 939 aa  297  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 711 aa  298  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5409  DNA topoisomerase III  30.25 
 
 		 714 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  32.04 
 
 		 992 aa  296  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  30.99 
 
 		 854 aa  293  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  32.77 
 
 		 982 aa  292  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  32.94 
 
 		 671 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  31.97 
 
 		 1002 aa  289  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  32.56 
 
 		 975 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  31.42 
 
 		 980 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  30.96 
 
 		 990 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  31.21 
 
 		 879 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  30.37 
 
 		 908 aa  283  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  30.56 
 
 		 707 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  32.59 
 
 		 671 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  32.52 
 
 		 981 aa  282  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  34.76 
 
 		 608 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  31.9 
 
 		 671 aa  282  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  32.94 
 
 		 670 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  30.73 
 
 		 889 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  30.95 
 
 		 888 aa  280  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  29.95 
 
 		 719 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  32.78 
 
 		 981 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  30.93 
 
 		 689 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  31.95 
 
 		 670 aa  279  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  31.95 
 
 		 670 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  30.73 
 
 		 681 aa  278  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  30.48 
 
 		 877 aa  276  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  30.33 
 
 		 865 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  30.33 
 
 		 865 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  30.33 
 
 		 865 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  33.14 
 
 		 655 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  31.7 
 
 		 920 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  30.2 
 
 		 865 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  30.2 
 
 		 865 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1425  DNA topoisomerase III  31.39 
 
 		 683 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.771336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  29.99 
 
 		 675 aa  273  7e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  29.27 
 
 		 712 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  30.34 
 
 		 865 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  30.57 
 
 		 876 aa  273  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  30.61 
 
 		 876 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 654 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 		 869 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 		 869 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 		 906 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 		 869 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 		 869 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 		 869 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  29.92 
 
 		 869 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  30.28 
 
 		 876 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  31.11 
 
 		 670 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  30.48 
 
 		 869 aa  270  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  31.38 
 
 		 676 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>