More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pBT9727_0072 on replicon NC_006578
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006578  pBT9727_0072  DNA topoisomerase  100 
 
 		 720 aa  1477    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5409  DNA topoisomerase III  91.32 
 
 		 714 aa  1356    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0093  topoisomerase IA  43.79 
 
 		 722 aa  586  1e-166  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  41.5 
 
 		 714 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  40.06 
 
 		 718 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2011  DNA topoisomerase III  40.39 
 
 		 714 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00587828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3433  DNA topoisomerase III  40.39 
 
 		 714 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000032124  hitchhiker  0.00000000499159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1984  DNA topoisomerase III  40.53 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1940  DNA topoisomerase III  40.53 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08242e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1767  DNA topoisomerase III  40.53 
 
 		 714 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1744  DNA topoisomerase III  40.53 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.129964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1725  DNA topoisomerase III  40.67 
 
 		 714 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1905  DNA topoisomerase III  40.53 
 
 		 714 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000492134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1911  DNA topoisomerase III  40.39 
 
 		 714 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1472  DNA topoisomerase III  40.25 
 
 		 714 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000939771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  35.34 
 
 		 799 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  34.26 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  35.34 
 
 		 695 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 746 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  31.38 
 
 		 675 aa  363  7.0000000000000005e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 		 712 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  32.45 
 
 		 707 aa  347  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  32.8 
 
 		 719 aa  342  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  30.75 
 
 		 754 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  34.06 
 
 		 730 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  35.4 
 
 		 722 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  32.06 
 
 		 768 aa  336  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  31.25 
 
 		 744 aa  336  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  35.91 
 
 		 731 aa  333  9e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  35.91 
 
 		 689 aa  330  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 721 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  33.73 
 
 		 676 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  33.98 
 
 		 729 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  35.29 
 
 		 731 aa  327  5e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1433  DNA topoisomerase III  33.39 
 
 		 706 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1486  DNA topoisomerase III  33.28 
 
 		 704 aa  325  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.892881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1498  DNA topoisomerase III  33.39 
 
 		 732 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2146  DNA topoisomerase III  31.6 
 
 		 654 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.232139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2461  DNA topoisomerase III  34.55 
 
 		 643 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.42133  normal  0.125855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  29.93 
 
 		 867 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  33.74 
 
 		 730 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0166  DNA topoisomerase III  34.81 
 
 		 687 aa  321  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3061  DNA topoisomerase III  32.97 
 
 		 702 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  32.45 
 
 		 680 aa  320  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  29.9 
 
 		 655 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1625  DNA topoisomerase III  33.03 
 
 		 672 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4319  DNA topoisomerase III  30.33 
 
 		 687 aa  316  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.535821  normal  0.574882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  30.2 
 
 		 741 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2718  DNA topoisomerase III  32.23 
 
 		 641 aa  316  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94815  hitchhiker  0.00169428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  33.09 
 
 		 673 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  34.1 
 
 		 686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  33.23 
 
 		 729 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4792  DNA topoisomerase III  32.18 
 
 		 649 aa  314  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2976  DNA topoisomerase III  33.23 
 
 		 666 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.930481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2088  DNA topoisomerase III  31.86 
 
 		 642 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00112487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1658  DNA topoisomerase III  32.22 
 
 		 679 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2830  DNA topoisomerase III  32.34 
 
 		 705 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  31.03 
 
 		 670 aa  313  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1979  DNA topoisomerase III  31.85 
 
 		 641 aa  313  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2343  DNA topoisomerase III  31.85 
 
 		 641 aa  313  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000133374  normal  0.0757376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  32.93 
 
 		 729 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  30.66 
 
 		 669 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  30.85 
 
 		 666 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1623  DNA topoisomerase III  31.48 
 
 		 705 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.730482 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1630  DNA topoisomerase III  32.26 
 
 		 647 aa  313  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 729 aa  312  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 729 aa  312  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 729 aa  312  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 729 aa  312  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 729 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1877  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 649 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000540839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  30.09 
 
 		 777 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2400  DNA topoisomerase III  32.09 
 
 		 668 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2753  DNA topoisomerase III  32.18 
 
 		 705 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  32.63 
 
 		 729 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2736  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 		 705 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2048  DNA topoisomerase III  31.53 
 
 		 649 aa  310  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.177023  normal  0.939846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1409  DNA topoisomerase III  31.53 
 
 		 649 aa  310  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0199719  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01732  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00246982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1879  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000411002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1847  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000137821  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1392  DNA topoisomerase III  31.37 
 
 		 649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.213648  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1869  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000214138  decreased coverage  0.00000617518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01720  hypothetical protein  31.69 
 
 		 653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00317357  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1425  DNA topoisomerase III  31.37 
 
 		 649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.864642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1986  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  31.71 
 
 		 670 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1428  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 651 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0037378  normal  0.804884 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  30.16 
 
 		 707 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  32.27 
 
 		 729 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1972  DNA topoisomerase III  32.12 
 
 		 641 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.28 
 
 		 608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  32.97 
 
 		 729 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2018  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 653 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000256516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2435  DNA topoisomerase III  32.34 
 
 		 708 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  29.54 
 
 		 865 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2483  DNA topoisomerase III  31.69 
 
 		 653 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000298229  normal  0.566589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  31.97 
 
 		 711 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  31.97 
 
 		 711 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  29.44 
 
 		 982 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>