More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1489 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  59.67 
 
 		 729 aa  885    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  47.25 
 
 		 711 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  59.13 
 
 		 729 aa  880    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  56.28 
 
 		 722 aa  817    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  59.13 
 
 		 729 aa  880    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  59.13 
 
 		 729 aa  880    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  58.86 
 
 		 729 aa  878    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  59.13 
 
 		 729 aa  880    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  59.13 
 
 		 729 aa  880    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  59.67 
 
 		 729 aa  884    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  52.52 
 
 		 721 aa  721    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  55.48 
 
 		 729 aa  813    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  58.04 
 
 		 729 aa  879    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  98.63 
 
 		 731 aa  1476    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 731 aa  1495    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  47.46 
 
 		 711 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  59.13 
 
 		 729 aa  877    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  52.41 
 
 		 686 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  58.47 
 
 		 730 aa  857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  59.13 
 
 		 729 aa  886    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  47.46 
 
 		 711 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  45.23 
 
 		 697 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  40.85 
 
 		 799 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  39.22 
 
 		 701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  39.26 
 
 		 695 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  37.61 
 
 		 754 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  38.33 
 
 		 876 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  38.5 
 
 		 906 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  38.31 
 
 		 889 aa  422  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  34.4 
 
 		 854 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  38.15 
 
 		 888 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  38.64 
 
 		 891 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  38.03 
 
 		 876 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  37.85 
 
 		 877 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  38.67 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  37.69 
 
 		 865 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  38.33 
 
 		 896 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  38.67 
 
 		 869 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  38.67 
 
 		 869 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  38.67 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  38.49 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  38.67 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  38.67 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  37.43 
 
 		 865 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  37.31 
 
 		 839 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  37.18 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  38.34 
 
 		 891 aa  416  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  37.43 
 
 		 865 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  37.43 
 
 		 865 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  37.93 
 
 		 865 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  38.52 
 
 		 846 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  37.62 
 
 		 865 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  37.08 
 
 		 865 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  35.43 
 
 		 867 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  36.14 
 
 		 920 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  41.13 
 
 		 608 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  36.78 
 
 		 876 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  36.49 
 
 		 768 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  36.03 
 
 		 679 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  36.44 
 
 		 975 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  36.03 
 
 		 679 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  37.15 
 
 		 981 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  36.08 
 
 		 1002 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  34.4 
 
 		 676 aa  396  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  36.51 
 
 		 982 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  36.93 
 
 		 990 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  37.15 
 
 		 981 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  36.44 
 
 		 620 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  36.08 
 
 		 992 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  39.23 
 
 		 712 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  41.34 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  35.99 
 
 		 980 aa  389  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  36.28 
 
 		 939 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  33.97 
 
 		 744 aa  389  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  32.58 
 
 		 730 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0911  DNA topoisomerase  35.13 
 
 		 741 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  34.98 
 
 		 680 aa  383  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  35.63 
 
 		 920 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  33.14 
 
 		 670 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  35.13 
 
 		 869 aa  382  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.36 
 
 		 573 aa  382  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  38.83 
 
 		 707 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  33.78 
 
 		 673 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  33.28 
 
 		 655 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  37.69 
 
 		 714 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  32.54 
 
 		 670 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  32.64 
 
 		 670 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  32.79 
 
 		 670 aa  379  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  33.8 
 
 		 707 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  33.72 
 
 		 675 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  34.29 
 
 		 876 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  33.09 
 
 		 670 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  34.11 
 
 		 653 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  32.87 
 
 		 666 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  32.25 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  35.98 
 
 		 719 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  33.94 
 
 		 652 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  32.25 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  33.94 
 
 		 653 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  36.08 
 
 		 851 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>