More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0943 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1318  DNA topoisomerase III  58.98 
 
 		 805 aa  915    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000791242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  64.33 
 
 		 873 aa  1102    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0943  DNA topoisomerase III  100 
 
 		 862 aa  1751    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.513939  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  37.81 
 
 		 746 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  39.24 
 
 		 867 aa  459  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  53.26 
 
 		 620 aa  426  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  40.99 
 
 		 701 aa  320  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0349  DNA topoisomerase  37.84 
 
 		 689 aa  308  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.26912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  37.35 
 
 		 865 aa  291  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  37.19 
 
 		 865 aa  290  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  38.29 
 
 		 754 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  35.71 
 
 		 695 aa  288  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  37.15 
 
 		 865 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  39.02 
 
 		 721 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  36.58 
 
 		 865 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  36.58 
 
 		 865 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  36.58 
 
 		 865 aa  283  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  36.83 
 
 		 865 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  37.95 
 
 		 876 aa  283  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  35.53 
 
 		 799 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  37.75 
 
 		 876 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 		 869 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 		 869 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 		 869 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 		 869 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  36.17 
 
 		 908 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 		 869 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 		 869 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  37.37 
 
 		 906 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  37.17 
 
 		 891 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  36.44 
 
 		 888 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  39.2 
 
 		 891 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  36.24 
 
 		 889 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  39.81 
 
 		 877 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  39.53 
 
 		 896 aa  273  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  34.81 
 
 		 920 aa  268  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  34.81 
 
 		 876 aa  267  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  36.7 
 
 		 854 aa  266  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 846 aa  263  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  37.4 
 
 		 879 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  35.62 
 
 		 981 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  35.62 
 
 		 981 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  36.13 
 
 		 982 aa  253  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  34.78 
 
 		 975 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  36.33 
 
 		 990 aa  251  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  38.07 
 
 		 686 aa  249  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  35.52 
 
 		 1002 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  36.99 
 
 		 722 aa  246  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0898  DNA topoisomerase III  33.72 
 
 		 869 aa  246  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  35.18 
 
 		 939 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  33.05 
 
 		 839 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  35.7 
 
 		 980 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  36.28 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  35.28 
 
 		 992 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  36.58 
 
 		 876 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  34.1 
 
 		 920 aa  236  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  33.93 
 
 		 718 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  34.99 
 
 		 851 aa  233  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  33.12 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1495  DNA topoisomerase III  35.64 
 
 		 697 aa  229  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0210844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3236  DNA topoisomerase  30.46 
 
 		 777 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  35.32 
 
 		 731 aa  225  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 730 aa  225  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  35.08 
 
 		 731 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  33.2 
 
 		 768 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  34.15 
 
 		 681 aa  222  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3602  DNA topoisomerase III  33.94 
 
 		 719 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1986  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 653 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2018  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 653 aa  222  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000256516  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01732  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 653 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00246982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1879  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 653 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000411002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1869  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 653 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000214138  decreased coverage  0.00000617518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1847  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 653 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000137821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01720  hypothetical protein  34.49 
 
 		 653 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00317357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2483  DNA topoisomerase III  34.49 
 
 		 653 aa  221  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000298229  normal  0.566589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1428  DNA topoisomerase III  34.24 
 
 		 651 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0037378  normal  0.804884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1684  DNA topoisomerase III  34.74 
 
 		 634 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1877  DNA topoisomerase III  33.75 
 
 		 649 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000540839  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2048  DNA topoisomerase III  34 
 
 		 649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.177023  normal  0.939846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1392  DNA topoisomerase III  34.77 
 
 		 649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.213648  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1425  DNA topoisomerase III  34.77 
 
 		 649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.864642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1409  DNA topoisomerase III  34 
 
 		 649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2718  DNA topoisomerase III  36.27 
 
 		 641 aa  217  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94815  hitchhiker  0.00169428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  35.15 
 
 		 707 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  32.96 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.59 
 
 		 608 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  33.49 
 
 		 729 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  31.06 
 
 		 714 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  33.49 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  33.49 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  33.49 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  33.49 
 
 		 729 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  33.26 
 
 		 729 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1979  DNA topoisomerase III  36.32 
 
 		 641 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2088  DNA topoisomerase III  36.32 
 
 		 642 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00112487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2343  DNA topoisomerase III  36.32 
 
 		 641 aa  213  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000133374  normal  0.0757376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2268  DNA topoisomerase III  35.32 
 
 		 641 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  35.83 
 
 		 675 aa  212  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  45.87 
 
 		 573 aa  213  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>