More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0335 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 747 aa  1521    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.14 
 
 		 837 aa  535  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  39.53 
 
 		 827 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  38.98 
 
 		 837 aa  524  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  38.3 
 
 		 843 aa  524  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  38.37 
 
 		 844 aa  523  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  43.28 
 
 		 931 aa  521  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  38.35 
 
 		 849 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  43.61 
 
 		 931 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  42.54 
 
 		 743 aa  509  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  42.73 
 
 		 744 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  37.61 
 
 		 834 aa  510  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  44.5 
 
 		 771 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  42.04 
 
 		 938 aa  503  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  37.13 
 
 		 863 aa  498  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  43.05 
 
 		 702 aa  498  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  42.96 
 
 		 942 aa  498  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.45 
 
 		 864 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  40.94 
 
 		 935 aa  464  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  33.12 
 
 		 780 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  31.18 
 
 		 855 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  34.35 
 
 		 812 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  33.38 
 
 		 817 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  34.07 
 
 		 814 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  32.45 
 
 		 853 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  33.9 
 
 		 814 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.01 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  32.19 
 
 		 604 aa  289  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  32.73 
 
 		 602 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  32.39 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  32.58 
 
 		 631 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  33.11 
 
 		 668 aa  258  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  31.68 
 
 		 596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  26.8 
 
 		 863 aa  251  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  30.05 
 
 		 828 aa  249  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 751 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  29.52 
 
 		 731 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  28.21 
 
 		 868 aa  244  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  32.64 
 
 		 721 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  29.59 
 
 		 729 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  30.8 
 
 		 693 aa  238  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  29.39 
 
 		 731 aa  237  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  28.15 
 
 		 722 aa  235  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  29.24 
 
 		 616 aa  234  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 689 aa  233  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  29.55 
 
 		 831 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  30.19 
 
 		 697 aa  231  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 831 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  27.48 
 
 		 853 aa  229  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 831 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  27.99 
 
 		 686 aa  227  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  29.73 
 
 		 765 aa  226  8e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.99 
 
 		 768 aa  226  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  29.59 
 
 		 702 aa  226  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  29.94 
 
 		 696 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 693 aa  225  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  29.87 
 
 		 694 aa  226  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 851 aa  225  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  29.02 
 
 		 684 aa  224  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 851 aa  225  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  29 
 
 		 620 aa  224  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  27.85 
 
 		 721 aa  223  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 695 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  28.28 
 
 		 629 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  30.26 
 
 		 695 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.1 
 
 		 691 aa  221  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.58 
 
 		 681 aa  219  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 780 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 704 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 693 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  30.61 
 
 		 714 aa  218  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 711 aa  217  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  30.47 
 
 		 695 aa  217  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 		 758 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 746 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  30.12 
 
 		 768 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.95 
 
 		 700 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  28.34 
 
 		 813 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  27.89 
 
 		 641 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.69 
 
 		 700 aa  213  9e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  28.15 
 
 		 729 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  28.15 
 
 		 729 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  28.15 
 
 		 729 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  28.15 
 
 		 729 aa  213  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  28.82 
 
 		 700 aa  213  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  27.18 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  28.01 
 
 		 729 aa  212  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  29.34 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  28.78 
 
 		 729 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  27.88 
 
 		 729 aa  211  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1738  DNA topoisomerase III  29.54 
 
 		 699 aa  211  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  28.6 
 
 		 680 aa  211  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  29.5 
 
 		 718 aa  211  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  28.65 
 
 		 767 aa  211  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  27.35 
 
 		 729 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  28.43 
 
 		 650 aa  210  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  27.88 
 
 		 729 aa  210  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  27.58 
 
 		 729 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>