More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09220 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  75.03 
 
 		 849 aa  1243    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  100 
 
 		 834 aa  1729    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  63.66 
 
 		 837 aa  1063    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  67.53 
 
 		 837 aa  1156    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  44.17 
 
 		 702 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  37.61 
 
 		 747 aa  513  1e-144  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  40.39 
 
 		 771 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  40.73 
 
 		 743 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  36.79 
 
 		 844 aa  511  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  36.19 
 
 		 843 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  36.78 
 
 		 827 aa  494  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  40.14 
 
 		 931 aa  487  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  38.89 
 
 		 744 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  39.47 
 
 		 931 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  39.26 
 
 		 942 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  35.37 
 
 		 863 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  36.31 
 
 		 864 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.21 
 
 		 938 aa  465  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  38.87 
 
 		 935 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  31.3 
 
 		 817 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  29.59 
 
 		 855 aa  349  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 812 aa  345  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  30.2 
 
 		 814 aa  341  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.26 
 
 		 780 aa  336  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  29.36 
 
 		 814 aa  333  8e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  28.59 
 
 		 853 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  31.15 
 
 		 631 aa  277  7e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  31.89 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  31.47 
 
 		 604 aa  272  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  30.39 
 
 		 602 aa  266  8.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  30.85 
 
 		 596 aa  256  8e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  29.58 
 
 		 604 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 668 aa  252  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  29.65 
 
 		 863 aa  241  5e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  29.91 
 
 		 743 aa  226  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  29.74 
 
 		 802 aa  224  7e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 869 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  28.81 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  27.82 
 
 		 859 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  28.08 
 
 		 869 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  28.08 
 
 		 869 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 693 aa  220  7e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 836 aa  219  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  29.33 
 
 		 757 aa  218  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 768 aa  218  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 758 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  27.83 
 
 		 869 aa  217  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  29.33 
 
 		 693 aa  217  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  28.9 
 
 		 691 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 760 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.51 
 
 		 841 aa  214  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.45 
 
 		 694 aa  213  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  29.26 
 
 		 759 aa  213  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  27.67 
 
 		 868 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 759 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  31.7 
 
 		 697 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 756 aa  211  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  28.14 
 
 		 868 aa  211  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 851 aa  211  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 804 aa  211  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  28.67 
 
 		 851 aa  211  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  27.21 
 
 		 793 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 836 aa  210  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  27.73 
 
 		 696 aa  210  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 798 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 696 aa  208  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  28.61 
 
 		 876 aa  208  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 857 aa  208  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  27.73 
 
 		 747 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 697 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  27.92 
 
 		 700 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  30.03 
 
 		 714 aa  207  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  26.87 
 
 		 868 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  27.69 
 
 		 616 aa  206  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  27.96 
 
 		 868 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 708 aa  206  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.43 
 
 		 704 aa  206  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  28.91 
 
 		 879 aa  206  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.12 
 
 		 868 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  27.99 
 
 		 693 aa  206  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  29.18 
 
 		 876 aa  205  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  28.53 
 
 		 701 aa  205  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3784  DNA topoisomerase I  27.44 
 
 		 728 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  27.94 
 
 		 700 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 703 aa  204  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 765 aa  204  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  29.27 
 
 		 853 aa  204  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 		 876 aa  204  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  27.95 
 
 		 876 aa  203  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 708 aa  204  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  27.64 
 
 		 877 aa  203  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  28.46 
 
 		 703 aa  203  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 870 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.01 
 
 		 789 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 711 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  26.93 
 
 		 865 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  26.8 
 
 		 865 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>