More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1139 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  75.4 
 
 		 834 aa  1244    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  65.03 
 
 		 837 aa  1079    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  74.32 
 
 		 837 aa  1266    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  100 
 
 		 849 aa  1739    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  44.31 
 
 		 702 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  41.72 
 
 		 771 aa  539  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  37.65 
 
 		 844 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  41.7 
 
 		 743 aa  527  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  38.35 
 
 		 747 aa  520  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  37.11 
 
 		 843 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  39.75 
 
 		 744 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  36.9 
 
 		 827 aa  514  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  40.33 
 
 		 931 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.47 
 
 		 864 aa  502  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  35.91 
 
 		 863 aa  501  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  39.09 
 
 		 931 aa  489  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  39.4 
 
 		 938 aa  475  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  40.06 
 
 		 935 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  37.41 
 
 		 942 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.1 
 
 		 855 aa  360  6e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  31.17 
 
 		 814 aa  352  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  31.23 
 
 		 780 aa  349  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  31.1 
 
 		 814 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  31.14 
 
 		 817 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  31.1 
 
 		 812 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  29.73 
 
 		 853 aa  314  4.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  32.76 
 
 		 602 aa  304  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  31.83 
 
 		 604 aa  296  9e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.54 
 
 		 610 aa  293  8e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  33.64 
 
 		 631 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  31.54 
 
 		 604 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  31.68 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  32.24 
 
 		 668 aa  244  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  31.47 
 
 		 743 aa  238  4e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  28.99 
 
 		 831 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 831 aa  235  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 760 aa  234  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  29.03 
 
 		 868 aa  234  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  28.59 
 
 		 831 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  28.87 
 
 		 746 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 859 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  29.68 
 
 		 701 aa  227  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  27.57 
 
 		 863 aa  227  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  29.88 
 
 		 757 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.15 
 
 		 868 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  31.93 
 
 		 697 aa  225  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  29.93 
 
 		 758 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  29.99 
 
 		 758 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  29 
 
 		 747 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 751 aa  223  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  29.83 
 
 		 710 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  30.77 
 
 		 836 aa  222  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  30.14 
 
 		 696 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  30.54 
 
 		 694 aa  221  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.3 
 
 		 869 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  29.05 
 
 		 693 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.3 
 
 		 869 aa  220  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 869 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.29 
 
 		 869 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  28.71 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 813 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 691 aa  218  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  30.39 
 
 		 868 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  30.53 
 
 		 870 aa  217  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 765 aa  217  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  30.39 
 
 		 868 aa  217  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  29.33 
 
 		 836 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  31.51 
 
 		 849 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.74 
 
 		 704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 768 aa  214  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  30.99 
 
 		 679 aa  214  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  28.76 
 
 		 804 aa  214  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  28.5 
 
 		 793 aa  213  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 765 aa  214  7.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 711 aa  213  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  28.69 
 
 		 756 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 876 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  28.76 
 
 		 706 aa  213  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  28.12 
 
 		 866 aa  212  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  27.15 
 
 		 697 aa  212  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  30.43 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  30.18 
 
 		 869 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.73 
 
 		 789 aa  211  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  29.45 
 
 		 868 aa  211  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  30.48 
 
 		 679 aa  211  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.65 
 
 		 841 aa  211  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  27.5 
 
 		 867 aa  210  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  29.68 
 
 		 776 aa  210  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 876 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 693 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 866 aa  210  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 898 aa  210  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 703 aa  209  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  29.5 
 
 		 686 aa  208  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  30.12 
 
 		 703 aa  208  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  29.01 
 
 		 693 aa  208  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 		 802 aa  207  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 876 aa  207  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  28.12 
 
 		 851 aa  207  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  28.12 
 
 		 851 aa  207  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>