More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1458 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  69.11 
 
 		 864 aa  1181    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  68.9 
 
 		 863 aa  1187    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  48.6 
 
 		 743 aa  655    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  88.51 
 
 		 843 aa  1529    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 827 aa  1677    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  68.84 
 
 		 844 aa  1152    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  46.4 
 
 		 771 aa  624  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  46.46 
 
 		 744 aa  624  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  46.24 
 
 		 931 aa  600  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  46.1 
 
 		 931 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  45.35 
 
 		 938 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  46.02 
 
 		 942 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  44.94 
 
 		 702 aa  554  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  44.49 
 
 		 935 aa  545  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  39.53 
 
 		 747 aa  544  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.79 
 
 		 837 aa  539  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  36.19 
 
 		 837 aa  523  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.03 
 
 		 849 aa  521  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  36.78 
 
 		 834 aa  499  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  32.41 
 
 		 855 aa  405  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.64 
 
 		 780 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  30.88 
 
 		 814 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  30.84 
 
 		 814 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  29.92 
 
 		 817 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 812 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  30.09 
 
 		 853 aa  324  3e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  33.93 
 
 		 604 aa  303  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  33.12 
 
 		 604 aa  296  8e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  32.43 
 
 		 631 aa  290  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  31.81 
 
 		 602 aa  289  2e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  32.57 
 
 		 596 aa  286  8e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  28.8 
 
 		 610 aa  264  4e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.67 
 
 		 691 aa  261  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 710 aa  251  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  31.33 
 
 		 697 aa  250  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.3 
 
 		 836 aa  249  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 689 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 859 aa  244  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.95 
 
 		 869 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  27.32 
 
 		 700 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  27.32 
 
 		 700 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  29.9 
 
 		 747 aa  241  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.91 
 
 		 869 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 751 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.44 
 
 		 768 aa  240  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  29.37 
 
 		 693 aa  240  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 765 aa  238  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 756 aa  236  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.15 
 
 		 841 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 789 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.66 
 
 		 743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 		 700 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  28.38 
 
 		 883 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 693 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  28.63 
 
 		 866 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  29.7 
 
 		 758 aa  235  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  28.03 
 
 		 876 aa  235  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  27.73 
 
 		 693 aa  234  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 866 aa  234  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  28.03 
 
 		 868 aa  234  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  27.97 
 
 		 746 aa  233  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  28.15 
 
 		 765 aa  233  9e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  30.21 
 
 		 757 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  29.07 
 
 		 870 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 868 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  28.07 
 
 		 836 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  25.32 
 
 		 691 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  25.32 
 
 		 691 aa  231  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 868 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  28.01 
 
 		 700 aa  231  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  27.53 
 
 		 868 aa  230  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  28.1 
 
 		 867 aa  230  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 		 695 aa  230  8e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 851 aa  230  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  28.31 
 
 		 851 aa  230  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.15 
 
 		 700 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  26.52 
 
 		 759 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.42 
 
 		 694 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  30.62 
 
 		 877 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  26.4 
 
 		 759 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  30.04 
 
 		 868 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  28.36 
 
 		 780 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  28.71 
 
 		 831 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 760 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  29.44 
 
 		 694 aa  228  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  27.79 
 
 		 868 aa  228  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 831 aa  228  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 691 aa  227  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 831 aa  227  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2657  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 865 aa  227  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000104499  unclonable  0.0000000870588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 813 aa  227  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  28.38 
 
 		 828 aa  226  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  28.93 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  28.3 
 
 		 704 aa  226  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1197  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 899 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  28.89 
 
 		 670 aa  225  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  29.94 
 
 		 876 aa  225  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>