More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3784 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1050  DNA topoisomerase I  59.53 
 
 		 726 aa  885    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0690587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3784  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 728 aa  1518    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3867  DNA topoisomerase I  55.18 
 
 		 720 aa  837    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.442129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2482  DNA topoisomerase I  54.22 
 
 		 720 aa  827    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0421727 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  35.31 
 
 		 700 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  38.17 
 
 		 711 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  34.41 
 
 		 700 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  34.13 
 
 		 700 aa  378  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  39.7 
 
 		 746 aa  373  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  40.34 
 
 		 751 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  35.57 
 
 		 696 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  33.65 
 
 		 693 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 868 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  36.71 
 
 		 710 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  37.13 
 
 		 691 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  36.65 
 
 		 703 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  36.2 
 
 		 703 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  35.94 
 
 		 684 aa  372  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  36.65 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  37.33 
 
 		 700 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  37.35 
 
 		 884 aa  371  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  33.74 
 
 		 783 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  37.16 
 
 		 700 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  37.3 
 
 		 708 aa  365  1e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  36.21 
 
 		 869 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  36.21 
 
 		 876 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  36.3 
 
 		 697 aa  364  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1783  DNA topoisomerase I  36.26 
 
 		 903 aa  364  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  36.91 
 
 		 767 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  35.73 
 
 		 892 aa  363  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  37.39 
 
 		 693 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  35.61 
 
 		 869 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  35.61 
 
 		 869 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  35.61 
 
 		 869 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  38.69 
 
 		 711 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  35.45 
 
 		 896 aa  362  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  34.29 
 
 		 869 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  36.67 
 
 		 868 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  35.87 
 
 		 977 aa  361  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  37.83 
 
 		 696 aa  361  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  36.67 
 
 		 868 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  35.28 
 
 		 879 aa  359  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  34.89 
 
 		 836 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  34.23 
 
 		 865 aa  359  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  35.31 
 
 		 872 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  35.52 
 
 		 886 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  37.88 
 
 		 697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  36.2 
 
 		 760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  34.77 
 
 		 695 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  36.75 
 
 		 869 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  34.05 
 
 		 868 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  34.05 
 
 		 865 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  34.05 
 
 		 865 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  39.97 
 
 		 836 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  37.28 
 
 		 694 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  34.05 
 
 		 865 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  35.88 
 
 		 868 aa  357  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  34.2 
 
 		 865 aa  357  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  34.2 
 
 		 865 aa  357  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  34.2 
 
 		 865 aa  357  5.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  34.2 
 
 		 865 aa  357  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  34.2 
 
 		 865 aa  357  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  34.2 
 
 		 865 aa  357  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  36.14 
 
 		 877 aa  357  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  34.2 
 
 		 865 aa  357  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  36.62 
 
 		 706 aa  356  6.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  34.2 
 
 		 865 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  35.06 
 
 		 868 aa  356  8.999999999999999e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  35.88 
 
 		 870 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  33.9 
 
 		 865 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  36.96 
 
 		 961 aa  355  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  35.53 
 
 		 702 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  33.9 
 
 		 865 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  39.65 
 
 		 859 aa  355  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  34.05 
 
 		 865 aa  355  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  35.55 
 
 		 695 aa  355  2e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  37.74 
 
 		 691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  38.92 
 
 		 765 aa  354  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  37.46 
 
 		 849 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  38.79 
 
 		 793 aa  354  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  34.53 
 
 		 894 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  34.53 
 
 		 894 aa  354  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  38.25 
 
 		 895 aa  354  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  32.88 
 
 		 879 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  34.42 
 
 		 748 aa  353  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  36.34 
 
 		 747 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  34.8 
 
 		 789 aa  353  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  34.63 
 
 		 894 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  34.43 
 
 		 895 aa  353  7e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  36.76 
 
 		 894 aa  353  8e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  35.28 
 
 		 706 aa  353  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  33.47 
 
 		 802 aa  352  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  38.83 
 
 		 815 aa  352  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  37.71 
 
 		 692 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  34.63 
 
 		 804 aa  352  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  36.58 
 
 		 708 aa  351  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  31.66 
 
 		 876 aa  351  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  38.75 
 
 		 765 aa  351  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  34.53 
 
 		 895 aa  351  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  33.74 
 
 		 867 aa  351  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>