More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1050 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2482  DNA topoisomerase I  53.45 
 
 		 720 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0421727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3784  DNA topoisomerase I  59.53 
 
 		 728 aa  885    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1050  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 726 aa  1507    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0690587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3867  DNA topoisomerase I  53.6 
 
 		 720 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.442129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  40.64 
 
 		 746 aa  405  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  36.91 
 
 		 706 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  39.87 
 
 		 747 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  39.11 
 
 		 789 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  39.33 
 
 		 696 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  39.02 
 
 		 760 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  34.59 
 
 		 706 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  35.8 
 
 		 693 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  37.44 
 
 		 703 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  38.86 
 
 		 758 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  37.83 
 
 		 836 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  39.33 
 
 		 751 aa  379  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  37.44 
 
 		 703 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  38.72 
 
 		 693 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  35.58 
 
 		 710 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  34.43 
 
 		 702 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  37.27 
 
 		 708 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  37.5 
 
 		 714 aa  379  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  36.01 
 
 		 684 aa  379  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  33.79 
 
 		 695 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  36.42 
 
 		 695 aa  374  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  36.32 
 
 		 700 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  37.42 
 
 		 711 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  37.63 
 
 		 711 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  39.58 
 
 		 748 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  36.48 
 
 		 700 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  36.48 
 
 		 700 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  35.26 
 
 		 691 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  38.57 
 
 		 708 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  36.18 
 
 		 706 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  37.3 
 
 		 703 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  37.94 
 
 		 793 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  33.07 
 
 		 798 aa  368  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  36.48 
 
 		 696 aa  369  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  36.82 
 
 		 700 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  37.15 
 
 		 767 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  35.71 
 
 		 702 aa  367  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  35.57 
 
 		 689 aa  365  1e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  36.29 
 
 		 798 aa  364  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  36.5 
 
 		 700 aa  365  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  36.73 
 
 		 694 aa  365  2e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  36.62 
 
 		 694 aa  364  3e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  37.74 
 
 		 697 aa  364  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  38.05 
 
 		 691 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  37.52 
 
 		 686 aa  363  9e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  37.98 
 
 		 977 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  37.97 
 
 		 836 aa  362  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  34.59 
 
 		 693 aa  362  1e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  40.14 
 
 		 961 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  37.19 
 
 		 894 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  36.45 
 
 		 783 aa  362  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  38.17 
 
 		 859 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  35.41 
 
 		 704 aa  361  3e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  36.19 
 
 		 669 aa  361  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  35.68 
 
 		 894 aa  360  5e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  35 
 
 		 896 aa  360  6e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  34.84 
 
 		 892 aa  359  8e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  33.29 
 
 		 831 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  33.42 
 
 		 831 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  33.6 
 
 		 831 aa  359  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  33.2 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  33.2 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  35.16 
 
 		 884 aa  358  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  38.27 
 
 		 799 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  32.97 
 
 		 697 aa  357  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  38.34 
 
 		 884 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  36.81 
 
 		 694 aa  356  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1783  DNA topoisomerase I  35.22 
 
 		 903 aa  356  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  38.41 
 
 		 816 aa  356  8.999999999999999e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  37.05 
 
 		 845 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  36.01 
 
 		 868 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  35.12 
 
 		 894 aa  356  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  36.58 
 
 		 865 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  35.53 
 
 		 841 aa  354  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  33.69 
 
 		 865 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  33.69 
 
 		 865 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  33.69 
 
 		 865 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  33.69 
 
 		 865 aa  354  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  33.69 
 
 		 865 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  33.52 
 
 		 868 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  36.44 
 
 		 743 aa  353  5e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  36.73 
 
 		 756 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  34.97 
 
 		 894 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  32.8 
 
 		 869 aa  353  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  35.73 
 
 		 715 aa  353  7e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  33.47 
 
 		 880 aa  353  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  37.31 
 
 		 780 aa  353  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  34.53 
 
 		 841 aa  353  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  38.44 
 
 		 692 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  37.75 
 
 		 914 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  34.97 
 
 		 894 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  36.56 
 
 		 916 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  35.81 
 
 		 879 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  38.27 
 
 		 692 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  33.56 
 
 		 896 aa  352  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  35.39 
 
 		 868 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>