More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0012 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  100 
 
 		 865 aa  1794    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  44.35 
 
 		 789 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  42.82 
 
 		 836 aa  629  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  44.6 
 
 		 767 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  43.23 
 
 		 780 aa  601  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 		 831 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  42.88 
 
 		 831 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  43.01 
 
 		 831 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  43.45 
 
 		 746 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  43.77 
 
 		 813 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  44.47 
 
 		 758 aa  591  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  42.97 
 
 		 751 aa  588  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  45.71 
 
 		 793 aa  585  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  44.47 
 
 		 747 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  43.84 
 
 		 853 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  44.6 
 
 		 693 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  42.46 
 
 		 760 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  43.54 
 
 		 894 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  43.97 
 
 		 695 aa  572  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  42.35 
 
 		 758 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  42.63 
 
 		 768 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  43.17 
 
 		 759 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  44.17 
 
 		 748 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  43.17 
 
 		 759 aa  562  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  42.33 
 
 		 710 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  44.75 
 
 		 702 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  43.17 
 
 		 851 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  42.26 
 
 		 836 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  43.17 
 
 		 851 aa  554  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  42.16 
 
 		 859 aa  553  1e-156  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  43.85 
 
 		 700 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  42.78 
 
 		 756 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  45.03 
 
 		 697 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  43.72 
 
 		 700 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  42.12 
 
 		 758 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  43.56 
 
 		 706 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 		 691 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  41.95 
 
 		 765 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  42.9 
 
 		 711 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  41.81 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  41.64 
 
 		 691 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  42.22 
 
 		 776 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  41 
 
 		 696 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  43.05 
 
 		 694 aa  538  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  43.8 
 
 		 693 aa  539  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  39.71 
 
 		 798 aa  532  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  42.12 
 
 		 757 aa  532  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  42.63 
 
 		 758 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  40.52 
 
 		 706 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.17 
 
 		 711 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  39.89 
 
 		 783 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 		 697 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  39.64 
 
 		 696 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  41.53 
 
 		 691 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  41.6 
 
 		 715 aa  525  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 		 841 aa  522  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  39.26 
 
 		 802 aa  521  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  40.83 
 
 		 779 aa  522  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  40.79 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  39.97 
 
 		 693 aa  522  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  40.7 
 
 		 779 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  40.68 
 
 		 689 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 		 798 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  40.08 
 
 		 804 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  40.81 
 
 		 703 aa  514  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  40.95 
 
 		 703 aa  515  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  41.71 
 
 		 706 aa  511  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  45.75 
 
 		 820 aa  512  1e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  39.81 
 
 		 798 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  42.63 
 
 		 915 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  41.35 
 
 		 714 aa  510  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  41.94 
 
 		 689 aa  512  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  38.1 
 
 		 799 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  42.38 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  40.11 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  40.25 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  40.11 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  40.68 
 
 		 703 aa  509  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  40.11 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 820 aa  507  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  40.11 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  39 
 
 		 798 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  42.12 
 
 		 884 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  40.11 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  42.12 
 
 		 884 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  42.38 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  40.25 
 
 		 692 aa  506  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  41.72 
 
 		 894 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  46.23 
 
 		 834 aa  503  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  40.11 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  42.12 
 
 		 869 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  42.4 
 
 		 922 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  40.11 
 
 		 692 aa  506  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  40.26 
 
 		 849 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  41.51 
 
 		 914 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  41.67 
 
 		 911 aa  506  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  42.04 
 
 		 911 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  42.1 
 
 		 916 aa  502  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  41.9 
 
 		 914 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 696 aa  499  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>