More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04555 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  100 
 
 
629 aa  1320    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  47.05 
 
 
828 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  46.4 
 
 
616 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  40.72 
 
 
1009 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  38.03 
 
 
641 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  34.06 
 
 
868 aa  318  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  31.46 
 
 
863 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  30.64 
 
 
610 aa  266  7e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  30.87 
 
 
780 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  29.86 
 
 
602 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  30.5 
 
 
604 aa  251  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  31.1 
 
 
596 aa  249  2e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  31.06 
 
 
631 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  29.37 
 
 
604 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 
702 aa  234  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  27.93 
 
 
855 aa  231  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 
747 aa  221  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 
744 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  29.34 
 
 
935 aa  212  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  28.5 
 
 
942 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.47 
 
 
938 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  28.06 
 
 
931 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  27.39 
 
 
743 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  27.78 
 
 
827 aa  207  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  27.34 
 
 
771 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  27.15 
 
 
843 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29 
 
 
864 aa  200  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  28.01 
 
 
931 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  28.25 
 
 
837 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  29.18 
 
 
863 aa  189  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  28.54 
 
 
849 aa  187  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  28.29 
 
 
834 aa  186  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  27.04 
 
 
837 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  26.84 
 
 
844 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  25.36 
 
 
817 aa  160  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  25.1 
 
 
814 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  25.29 
 
 
812 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  24.9 
 
 
814 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.698596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  25.49 
 
 
668 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  25.49 
 
 
853 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  26.5 
 
 
919 aa  133  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  27.35 
 
 
868 aa  126  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  24.75 
 
 
689 aa  126  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  26.73 
 
 
869 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  26.73 
 
 
869 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  26.73 
 
 
869 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  26.88 
 
 
768 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  25.72 
 
 
923 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  25.16 
 
 
868 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  25.16 
 
 
868 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  27.66 
 
 
869 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  26.27 
 
 
695 aa  120  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  25.15 
 
 
700 aa  120  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1820  DNA topoisomerase I  27.19 
 
 
746 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000828965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  24.89 
 
 
701 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  25.2 
 
 
700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  25.54 
 
 
700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  26.55 
 
 
852 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  25.68 
 
 
879 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  24.81 
 
 
707 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  27.21 
 
 
876 aa  117  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  24.55 
 
 
691 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  24.55 
 
 
691 aa  117  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 
869 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  25.25 
 
 
693 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  23.84 
 
 
729 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  25.74 
 
 
868 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  24.22 
 
 
700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  24.11 
 
 
722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  24.65 
 
 
721 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  24.55 
 
 
700 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  24.11 
 
 
730 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  25 
 
 
867 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  23.92 
 
 
697 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 
898 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  25.41 
 
 
865 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  25.17 
 
 
689 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  23.34 
 
 
712 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  25.58 
 
 
839 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  25.99 
 
 
695 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  26.8 
 
 
870 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2178  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 
884 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  24.4 
 
 
620 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 
798 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0850  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 
884 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.999873  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  25.57 
 
 
865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0434  DNA topoisomerase I  24.23 
 
 
768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  25.57 
 
 
865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  24.76 
 
 
693 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 
877 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  25.57 
 
 
865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 
877 aa  112  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  25.57 
 
 
865 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  25.57 
 
 
865 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  25.56 
 
 
704 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  25.43 
 
 
893 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  24.14 
 
 
715 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 
894 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  23.74 
 
 
754 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  27.19 
 
 
841 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.767533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>