More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0434 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1820  DNA topoisomerase I  60.94 
 
 		 746 aa  908    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000828965  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0434  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 768 aa  1537    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  38.52 
 
 		 793 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  46.69 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  46.59 
 
 		 691 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  39.03 
 
 		 799 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  38.93 
 
 		 802 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  46.23 
 
 		 706 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  39.45 
 
 		 798 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  45.11 
 
 		 702 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  46.23 
 
 		 693 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  37.97 
 
 		 836 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  38.94 
 
 		 804 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  45.82 
 
 		 695 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  40.42 
 
 		 798 aa  504  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  45.45 
 
 		 695 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  37.61 
 
 		 780 aa  502  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  44.8 
 
 		 700 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  44.63 
 
 		 697 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  44.46 
 
 		 700 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  37.71 
 
 		 798 aa  495  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.38 
 
 		 711 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  45.23 
 
 		 700 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  45.56 
 
 		 700 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  43.74 
 
 		 694 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  44.05 
 
 		 693 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  43.87 
 
 		 710 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  44 
 
 		 690 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  44.63 
 
 		 700 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  43.85 
 
 		 696 aa  492  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  39.66 
 
 		 798 aa  492  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  36.54 
 
 		 831 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  39.21 
 
 		 746 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  37.79 
 
 		 853 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  37.89 
 
 		 789 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  41.44 
 
 		 686 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  44.13 
 
 		 715 aa  491  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  44.95 
 
 		 684 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  36.15 
 
 		 831 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  42.81 
 
 		 696 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  41.71 
 
 		 751 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  44.82 
 
 		 706 aa  488  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  39.31 
 
 		 743 aa  488  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  36.15 
 
 		 831 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  42.95 
 
 		 703 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  42.23 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  41.4 
 
 		 747 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  40.7 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  42.76 
 
 		 703 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  42.95 
 
 		 703 aa  485  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  38.03 
 
 		 756 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  46.21 
 
 		 633 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  44.59 
 
 		 714 aa  480  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  43.45 
 
 		 694 aa  476  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  38.55 
 
 		 757 aa  475  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  37.86 
 
 		 758 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  45.5 
 
 		 633 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  43.77 
 
 		 708 aa  475  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  42.93 
 
 		 694 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  44.24 
 
 		 721 aa  469  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  42.38 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  35.72 
 
 		 813 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  36.05 
 
 		 867 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  42.38 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  40.33 
 
 		 696 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  36.05 
 
 		 866 aa  465  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  38.82 
 
 		 760 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  36.01 
 
 		 866 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  38.41 
 
 		 865 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 706 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  43.33 
 
 		 689 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  38.87 
 
 		 758 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  42.39 
 
 		 762 aa  461  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  42.42 
 
 		 704 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  38.2 
 
 		 758 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  34.59 
 
 		 836 aa  462  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  40.76 
 
 		 859 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  35.6 
 
 		 767 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  42.36 
 
 		 696 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  41.43 
 
 		 689 aa  458  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  36.53 
 
 		 779 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  41.65 
 
 		 702 aa  459  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  36.65 
 
 		 779 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  39.46 
 
 		 748 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  35.34 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  36.52 
 
 		 758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  35.54 
 
 		 868 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  43.5 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  37.55 
 
 		 776 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1803  DNA topoisomerase I  35.63 
 
 		 906 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0789615  hitchhiker  0.0000387309 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  35.34 
 
 		 865 aa  452  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  34.51 
 
 		 898 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>