More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0690 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 633 aa  1283    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  94.31 
 
 		 633 aa  1226    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  52.68 
 
 		 702 aa  599  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  49.46 
 
 		 696 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  47.35 
 
 		 762 aa  544  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  44.55 
 
 		 693 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  44.82 
 
 		 702 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  44.17 
 
 		 691 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.48 
 
 		 711 aa  475  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  44.19 
 
 		 686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  44.17 
 
 		 693 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  44.54 
 
 		 696 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0434  DNA topoisomerase I  46.28 
 
 		 768 aa  465  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  42.6 
 
 		 697 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  41.59 
 
 		 694 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  41.07 
 
 		 696 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  42.46 
 
 		 710 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  44.1 
 
 		 693 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  42.62 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  42.62 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  40.58 
 
 		 747 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  42.13 
 
 		 696 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  43.47 
 
 		 700 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  43.63 
 
 		 700 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  42.72 
 
 		 859 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  42.39 
 
 		 711 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1820  DNA topoisomerase I  44.11 
 
 		 746 aa  457  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000828965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  42.39 
 
 		 697 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  43.54 
 
 		 836 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  41.37 
 
 		 760 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  40.9 
 
 		 793 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  41.61 
 
 		 715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  42.18 
 
 		 706 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  42.23 
 
 		 836 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 789 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  42.74 
 
 		 708 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  41.46 
 
 		 751 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  43.86 
 
 		 706 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  44.32 
 
 		 700 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  43.99 
 
 		 700 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  42.17 
 
 		 714 aa  445  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  41.07 
 
 		 692 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  41.97 
 
 		 689 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 700 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  41.79 
 
 		 695 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  41.07 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  40.99 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  41.07 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 		 894 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  41.07 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  41.07 
 
 		 692 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  42.14 
 
 		 706 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  42.67 
 
 		 853 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  40.38 
 
 		 692 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  42.05 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  41.16 
 
 		 703 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  40.03 
 
 		 692 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  42.18 
 
 		 695 aa  437  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  41.83 
 
 		 691 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  40.33 
 
 		 684 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  40.23 
 
 		 692 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  42.46 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  40.03 
 
 		 692 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  41.65 
 
 		 690 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  40.18 
 
 		 703 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  41.28 
 
 		 758 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  39.88 
 
 		 692 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  42.05 
 
 		 757 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  42.24 
 
 		 708 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  42.69 
 
 		 702 aa  432  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  41 
 
 		 703 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  40.88 
 
 		 767 aa  432  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  41.73 
 
 		 704 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  41.54 
 
 		 721 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  42.3 
 
 		 743 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  40.93 
 
 		 756 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  40.19 
 
 		 813 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  39.72 
 
 		 831 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  38.35 
 
 		 758 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  41.07 
 
 		 758 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  41.61 
 
 		 746 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  39.19 
 
 		 831 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  40.15 
 
 		 798 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  39.44 
 
 		 798 aa  420  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  40.74 
 
 		 799 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  39.38 
 
 		 831 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  40.97 
 
 		 798 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  40.32 
 
 		 780 aa  419  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  40.13 
 
 		 694 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 694 aa  419  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  39.17 
 
 		 869 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 		 779 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  40.49 
 
 		 748 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  39.17 
 
 		 869 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  39.16 
 
 		 877 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  40.97 
 
 		 779 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  41.49 
 
 		 758 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  39.17 
 
 		 869 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  41.02 
 
 		 689 aa  410  1e-113  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  38.87 
 
 		 869 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>