More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1027 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 702 aa  1425    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  61.79 
 
 		 696 aa  757    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  51.47 
 
 		 633 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  52.72 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  50.48 
 
 		 762 aa  600  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  46.25 
 
 		 702 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  46.6 
 
 		 696 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  44.89 
 
 		 751 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  46.43 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  46.26 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  44.08 
 
 		 710 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  46.86 
 
 		 693 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  44.65 
 
 		 836 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  43.87 
 
 		 697 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  42.99 
 
 		 694 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 859 aa  481  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 711 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  43.95 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  41.99 
 
 		 711 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1820  DNA topoisomerase I  46.28 
 
 		 746 aa  475  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000828965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  45.03 
 
 		 700 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  45.12 
 
 		 700 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  44.77 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  44.77 
 
 		 691 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  42.93 
 
 		 789 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 747 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  43.8 
 
 		 692 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  43.78 
 
 		 686 aa  468  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  42.26 
 
 		 836 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  41.4 
 
 		 760 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  43.16 
 
 		 696 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  45.8 
 
 		 700 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  42.63 
 
 		 758 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  43.82 
 
 		 695 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  45.47 
 
 		 700 aa  462  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  43.83 
 
 		 706 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  43.16 
 
 		 715 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 692 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  43.27 
 
 		 691 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  44.34 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  42.44 
 
 		 669 aa  460  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  43.65 
 
 		 714 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  45.63 
 
 		 700 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  40.4 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  41.69 
 
 		 696 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  42.83 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  43 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  42.83 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  42.83 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  42.83 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  41.41 
 
 		 697 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  42.48 
 
 		 690 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  41.29 
 
 		 693 aa  456  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  41.71 
 
 		 694 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  43.13 
 
 		 689 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  42.83 
 
 		 692 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  42.67 
 
 		 692 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  41.64 
 
 		 793 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  42.67 
 
 		 692 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  42.98 
 
 		 743 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  43.96 
 
 		 746 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  42.51 
 
 		 692 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  41.46 
 
 		 706 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  40.06 
 
 		 813 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  44.06 
 
 		 695 aa  444  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  44.48 
 
 		 702 aa  443  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  41.94 
 
 		 758 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  40.15 
 
 		 894 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  41.99 
 
 		 758 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  43.19 
 
 		 689 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  39.53 
 
 		 767 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  41.84 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  39.97 
 
 		 831 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  41.46 
 
 		 841 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  41.85 
 
 		 780 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  39.97 
 
 		 831 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0434  DNA topoisomerase I  43.36 
 
 		 768 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  41.76 
 
 		 748 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  43.79 
 
 		 704 aa  436  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  41.4 
 
 		 757 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  42.52 
 
 		 816 aa  431  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  41.19 
 
 		 804 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  41.14 
 
 		 758 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  39.81 
 
 		 831 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  40.66 
 
 		 820 aa  429  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  41.84 
 
 		 853 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  42.95 
 
 		 694 aa  431  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  39.68 
 
 		 851 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  41.17 
 
 		 721 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  41.38 
 
 		 820 aa  429  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  39.77 
 
 		 802 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  41.18 
 
 		 756 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  40.43 
 
 		 776 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  39.68 
 
 		 851 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  37.85 
 
 		 703 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  40.28 
 
 		 783 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  40 
 
 		 703 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0594  DNA topoisomerase I  40.67 
 
 		 827 aa  420  1e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  37.85 
 
 		 703 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  38.25 
 
 		 884 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>