240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1309 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  100 
 
 		 262 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  40.26 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  35.63 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  32.17 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  34.7 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  35.38 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  33.96 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  32.06 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  35.14 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  32.56 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  39.79 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  31.97 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  33.88 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  33.2 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  33.84 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  33.84 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  39.29 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  32.13 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  37.76 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  48.04 
 
 		 338 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  42.15 
 
 		 207 aa  95.9  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  34.19 
 
 		 353 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  36 
 
 		 387 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  26.91 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  32.67 
 
 		 702 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 704 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  29.84 
 
 		 812 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 817 aa  62  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 694 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  61.76 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  61.76 
 
 		 814 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  30.07 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  36.08 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 694 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.71 
 
 		 695 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.7 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  31.01 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  63.64 
 
 		 853 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  25.4 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  26.67 
 
 		 684 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  25.87 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  29.91 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  46.34 
 
 		 762 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  36.36 
 
 		 708 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  57.14 
 
 		 885 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5226  nerd domain protein  21.98 
 
 		 320 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0869154  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  25.62 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  48.57 
 
 		 768 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  54.29 
 
 		 877 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5243  nerd domain protein  24.14 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  41.27 
 
 		 695 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0569  DNA topoisomerase I  54.29 
 
 		 877 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4808  hypothetical protein  25.56 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0019  nerd domain protein  21.78 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.580862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  54.29 
 
 		 849 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 		 914 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0442  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  54.55 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826807  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  54.29 
 
 		 977 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4947  hypothetical protein  25.11 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5325  hypothetical protein  25.11 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  41.18 
 
 		 798 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0359  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  45.95 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0044685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  40.43 
 
 		 783 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  40.82 
 
 		 759 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 743 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  57.14 
 
 		 747 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  52.94 
 
 		 894 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4350  DNA topoisomerase I  52.94 
 
 		 913 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.350571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  26.36 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  40.82 
 
 		 759 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3660  NERD domain-containing protein  25.39 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  24.32 
 
 		 931 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  23 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3786  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  45.95 
 
 		 185 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000331014  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  31.75 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3965  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  45.95 
 
 		 185 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0249698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  26.92 
 
 		 756 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  52.94 
 
 		 961 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0028  DNA topoisomerase I  40.35 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369311  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002062  Zn-finger domain-containing protein  43.9 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5192  nerd domain protein  22.69 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 758 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0048  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  54.55 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.256643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  51.43 
 
 		 896 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  52.94 
 
 		 894 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3707  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  37.74 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281277  normal  0.131734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  47.22 
 
 		 911 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3770  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  37.74 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3599  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  37.74 
 
 		 180 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000119283  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  25.41 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3766  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  51.52 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000848781  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3672  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  37.74 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  47.22 
 
 		 922 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  47.22 
 
 		 936 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  59.38 
 
 		 849 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  47.22 
 
 		 916 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>