28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3513 on replicon NC_009469
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  100 
 
 
226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  33.97 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  20.28 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  31.03 
 
 
269 aa  55.1  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  26.54 
 
 
355 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  25.7 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  20.77 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  25 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  29.69 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  25.81 
 
 
262 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  25.83 
 
 
361 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  27.66 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  25.58 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  26.87 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  30.84 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  29.82 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  29.82 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  29.82 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  28.57 
 
 
361 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  29.25 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  32.61 
 
 
329 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  25 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  32.61 
 
 
338 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  29.77 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5325  hypothetical protein  25.37 
 
 
320 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4947  hypothetical protein  25.37 
 
 
320 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4808  hypothetical protein  27.12 
 
 
320 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>