23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5568 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  60.79 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3742  hypothetical protein  45.03 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3748  hypothetical protein  31.01 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281003  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  29.91 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  35.06 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  30.7 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  27.27 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  26.92 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  32.67 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  25.95 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  35.38 
 
 		 338 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0706  hypothetical protein  60.71 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  27.5 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  33.85 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  33.85 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  28.67 
 
 		 353 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  26.52 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  59.26 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  28.45 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3714  hypothetical protein  28.83 
 
 		 205 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  29.91 
 
 		 207 aa  42  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  59.26 
 
 		 331 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>